科学网—niuneat的博文

置顶 · 升级版|16srRNA微生物多样性测序报告解读

2021-4-1 17:29

微生物多样性测序（扩增子测序）是基于二代高通量测序对16S/18S/ITS等序列进行测序。可以同时检测样本中的优势物种、稀有物种及一些未知物种的检测，获得样本的微生物群落组成以及相对丰度。相信关注我们的小伙伴对此并不陌生。这次我们整合了大家平时会遇到的一些问题，在原有的基础上对报告进一步完善。 ...

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置顶 · [转载]多快好省的宏基因组研究技巧 — 资深专家分享

2020-4-27 13:34

谷禾健康原创近年的研究热点集中于环境和生物体相互作用的微生物群体，而大量复杂的微生物群体存在培养困难，构成复杂（包括细菌、古菌、真菌、原生生物、病毒甚至小型真核生物）。因此如何用高通量精准的了解这些群体的构成，基因功能分布以及具体的表达活性和代谢状况成为首要问题。高通量测序技术 ...

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置顶 · [转载]微生物多样性测序结果如何看？

隐藏 2019-11-18 14:37

原文如何读懂和利用你的微生物多样性测序结果？谷禾健康原创做过16s测序的小伙伴们都知道测完之后会拿到一份结果报告但这并不代表可以开始写文章了看似一大堆数据图表却不知如何下手这是很多人头疼的地方那么怎样给报告中的数据赋予灵魂让它真正成为对你有帮助的分析呢？今天我们来详细解 ...

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[转载]这7种类型的食物可能引起 “痘痘”

牛耀芳 2020-11-19 11:30

谷禾健康痤疮（俗称“痘痘”）是一种常见的皮肤病，会影响全球近10％的人口。导致痤疮发展的因素很多，包括皮脂和角蛋白的产生，引起痤疮的细菌，激素，毛孔阻塞和炎症。饮食与痤疮之间的联系一直存在争议，但最近的研究表明饮食在痤疮的发生中可以发挥重要作用。本文将列举以下7种可能引起痤疮的食物，并提供一 ...

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[转载]痘痘？粉刺？皮肤问题很可能是肠道问题

牛耀芳 2020-11-19 10:53

谷禾健康痘痘，粉刺，酒渣鼻等皮肤问题，困扰着一些爱美的朋友。这关乎到个人形象，甚至有些朋友还会因为这个感到焦虑，社交尴尬，严重影响自信。为了祛痘，盲目往脸上涂抹太多祛痘护肤产品，正所谓“过犹不及”，涂抹太多，过量，不断刺激皮肤，雪上加霜。改善皮肤和整体健康的关键，从你的肠道开始。我们常 ...

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[转载]蟑螂相关菌与人类健康风险

牛耀芳 2020-11-17 11:15

谷禾健康说起蟑螂，大部分人都不太喜欢，甚至生理性恐惧... 你可能有100个讨厌它的理由，见到它就想消灭它，然而怎么都灭不完... 算起来，蟑螂早在3亿年前就已经存在了。蟑螂在线数据库中登记了4685种蟑螂（截止2020.8）。它拥有极强的适应力，亿万年来生生不息，广泛分布在世界各个角落。蟑螂有多强的生存 ...

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饮食与抑郁症密不可分，一文涵盖多种生物学机制

牛耀芳 2020-11-13 17:17

焦虑，抑郁，双相情感障碍，这类词越来越多出现在我们的生活。你也许不知道，饮食可以通过多种途径影响心理健康即便知道了饮食干预可以改善抑郁，那么如何进行饮食干预呢？饮食干预措施有好几大类，包括：营养干预措施（例如锌，omega-3脂肪酸）；食品干预措施（例如绿茶，橄榄油）；全饮食干预措施（例如地中海 ...

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[转载]健康的人类微生物组

牛耀芳 2020-11-11 12:36

谷禾健康识别和纠正疾病患者微生物组的重要第一步，就是要了解健康微生物组的特性，及没有明显疾病情况下的许多不同的微生物生态。我们知道体内DNA的细微差异引起巨大的表型多样性，也就是说大家都能区分彼此。相比之下，人体微生物的宏基因组（微生物在我们体内的总DNA含量）变化更大，只有三分之一的组成基因存 ...

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[转载]肺炎链球菌的社交网络

牛耀芳 2020-11-6 13:57

谷禾健康 S. pneumoniae (or pneumococcus，肺炎链球菌）是中耳炎、细菌性脑膜炎、败血症和社区获得性肺炎的主要病因。世卫组织将肺炎链球菌列为一种抗生素耐药的“优先病原体 ”。肺炎链球菌是下呼吸道感染的主要原因之一，每年在全世界造成近100万儿童死亡。肺炎链球菌在人类宿主中占据不同的生态位， ...

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[转载]革兰氏阳性菌的详细分类及特征

牛耀芳 2020-11-3 10:20

细菌感染严重威胁人类健康。如果你去医院就医，医生怀疑你有感染，可能会要求进行革兰氏染色检查。该测试还可以帮助医生了解细菌是革兰氏阴性还是革兰氏阳性，从而选择合适的治疗方式。然而你可能对于革兰氏阳性菌阴性菌这些概念并不熟悉，今天为大家讲解下，革兰氏阳性菌，革兰氏阴性菌的区别，革兰氏染色法，常见的革 ...

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[转载]生物数据可视化着色的十个简单规则

牛耀芳 2020-11-2 15:10

谷禾健康用于生物数据可视化的方法不断改进，但是在一些可视化图形的着色方面仍然存在根本性的挑战。生物学数据的视觉不应淹没，掩盖或偏倚结果，而应使其更易于理解。这是对于在创建可视化效果时如何有效使用颜色的挑战。生物数据的可视化处理是计算机图形学，科学可视化和信息可视化在生命科学各个领域的应 ...

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[转载]人类微生物组测序数据的聚类：基于距离的无监督学习模型

牛耀芳 2020-11-2 11:15

谷禾健康在现代测序技术的帮助下，微生物组研究的范围被扩大，通过 16S rRNA测序或鸟枪法宏基因组测序可以生成大量的微生物组数据。而微生物群落研究中的一个重要问题是对这些微生物的归类，模拟和分析人类微生物群。通常使用16S rRNA技术量化微生物群落的组成，但量化后的数据是偏斜的，带有过多的0。目前还 ...

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[转载]肠道微生物群在冠心病中的作用

牛耀芳 2020-10-30 09:54

谷禾健康冠心病患者的肠道微生物群存在差异，这已成为共识。研究表明，肠道微生物群与肥胖、糖尿病、血脂异常和高血压有关，这些都是冠心病的危险因素。肠道微生物群通过其代谢产物参与介导胆固醇代谢、尿酸代谢、氧化应激和炎症反应等基本代谢过程，可诱导动脉粥样硬化和冠心病的发生。干扰肠道微生物群的组成， ...

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