科学网—niuneat的博文

置顶 · 升级版|16srRNA微生物多样性测序报告解读

2021-4-1 17:29

微生物多样性测序（扩增子测序）是基于二代高通量测序对16S/18S/ITS等序列进行测序。可以同时检测样本中的优势物种、稀有物种及一些未知物种的检测，获得样本的微生物群落组成以及相对丰度。相信关注我们的小伙伴对此并不陌生。这次我们整合了大家平时会遇到的一些问题，在原有的基础上对报告进一步完善。 ...

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置顶 · [转载]多快好省的宏基因组研究技巧 — 资深专家分享

2020-4-27 13:34

谷禾健康原创近年的研究热点集中于环境和生物体相互作用的微生物群体，而大量复杂的微生物群体存在培养困难，构成复杂（包括细菌、古菌、真菌、原生生物、病毒甚至小型真核生物）。因此如何用高通量精准的了解这些群体的构成，基因功能分布以及具体的表达活性和代谢状况成为首要问题。高通量测序技术 ...

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置顶 · [转载]微生物多样性测序结果如何看？

隐藏 2019-11-18 14:37

原文如何读懂和利用你的微生物多样性测序结果？谷禾健康原创做过16s测序的小伙伴们都知道测完之后会拿到一份结果报告但这并不代表可以开始写文章了看似一大堆数据图表却不知如何下手这是很多人头疼的地方那么怎样给报告中的数据赋予灵魂让它真正成为对你有帮助的分析呢？今天我们来详细解 ...

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[转载]大脑退行疾病的两个重要诱因：氧化应激和肠道失衡

牛耀芳 2024-8-19 11:36

人的脑部大约有860亿个神经元和数万亿个突触连接，由250-300亿的神经胶质细胞支持，消耗基础氧气中约20%的比例来维持ATP驱动的活动。与其他器官相比，大脑及其神经组织由于其高代谢率和能量活动而产生大量的 ROS（活性氧）。与此同时，与其他组织相比，大脑的抗氧化防御系统较弱，因此容易出 ...

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[转载]生命前1000天的微生物群落与生殖健康

牛耀芳 2024-8-13 21:53

众多的文献和谷禾之前写过的文章都阐述了微生物群与人类健康密切相关。这种联系甚至可能在还未出生的时候就已经开始形成。微生物群的存在和活动从母体怀孕前到幼年的过程中，持续地参与和调节着人体的各种生理功能，从而在每一个生命阶段都扮演着至关重要的角色。在受孕之前，男性和女性生殖 ...

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[转载]寻找适合你的健康饮食方式-试着问问肠道菌群

牛耀芳 2024-8-13 18:04

饮食在塑造肠道微生物群的组成、功能和多样性方面起着关键作用，各种饮食对肠道内微生物群落的稳定性、功能性和多样性有着深远的影响。了解不同饮食对微生物群的深远影响至关重要，改善代谢和肠道健康，预防和减缓由饮食不当引起的特定饮食相关疾病的发生。在生命早期，分娩方式、喂养、饮食和环 ...

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[转载]16S扩增子测序技术方法选择和应用特点

牛耀芳 2024-8-13 15:38

16s 测序几十年来， 16S rRNA基因一直是基于序列的细菌分析的基石。 16S rRNA 基因是识别复杂群落中微生物的快速有效标记，因此已被用于人类微生物组计划 (HMP) 、地球微生物组计划 (EMP) 和人类肠道宏基因组学 (MetaHIT) 等研究。该基因的一大优势在于，其分析方法不依赖于样本中细菌的可培养 ...

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[转载]肠道重要菌属——丁酸弧菌属(Butyrivibrio)，产丁酸，抗炎抗氧化

牛耀芳 2024-8-13 15:30

丁酸弧菌属 ( Butyrivibrio )是人体的重要菌属，属于厚壁菌门毛螺菌科，毛螺菌科包括了人体很多重要的菌属，与健康紧密相关。该菌最早于1956年被发现，其革兰氏染色呈阴性，但具有非常薄的革兰氏阳性细胞壁结构。丁酸弧菌属严格厌氧，不产生孢子。目前已知该菌属包含60多种菌株，溶纤维丁酸 ...

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[转载]癌症和微生物组：细菌如何影响免疫疗法

牛耀芳 2024-8-5 12:12

认识免疫疗法免疫疗法是一种利用人体自身的免疫系统来对抗疾病的方法，尤其是在癌症治疗中，它通过激活或增强免疫系统来识别和攻击癌细胞。这一疗法的核心在于激发免疫系统对肿瘤细胞的特异性反应，从而达到治疗目的。免疫疗法具有高度的选择性和靶向性，能够减少对正常细胞的伤害 ...

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[转载]真实案例 | 重塑肠道生态，如何利用膳食纤维调理肠菌实现高效减肥

牛耀芳 2024-7-19 11:28

“ 胖！可怎么办？ ”《柳叶刀》发布的一项报告称，截止2022年，全球超过10亿人患有肥胖症，超过20亿人存在超重。从1990年到2022年间，全球患肥胖症的成年人增加了一倍多，患肥胖症的儿童和青少年 (5至19岁)更是增加了约3倍。超重和肥胖已成为全球日益严重的流行病。超重和肥胖的不良影响可能不会马上体 ...

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[转载]Christensenella minuta——下一代益生菌候选者：改善代谢、减轻炎症

牛耀芳 2024-7-19 10:56

小克里斯滕森氏菌 ( Christensenella minuta )是一种革兰氏阴性、不产生孢子、不运动的细菌：它属于厚壁菌门，这是细菌界中最大的门之一，包括多种对人类健康有重要影响的细菌。在厚壁菌门下， C.minuta 属于梭菌纲，这一纲的细菌多为厌氧菌，能在缺氧的环境中生长。梭菌目是梭菌纲下的一 ...

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[转载]质子泵抑制剂的副作用与肠道健康：科学应对胃病挑战

牛耀芳 2024-7-19 10:49

质子泵抑制剂 (PPI)是一种抑制胃酸分泌最有效和最常见的胃酸抑制药物，于 1989年被引入医学领域，可阻断胃壁细胞中的 H+/K+ ATPase 酶系统，从而抑制壁细胞分泌氢，并抑制细胞外钾的吸收，这种机制抑制了胃壁细胞的酸分泌。由于质子泵抑制剂抑制胃酸分泌的能力，已成为治疗和预防胃 ...

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