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- 置顶 · 升级版|16srRNA微生物多样性测序报告解读
- 微生物多样性测序（扩增子测序）是基于二代高通量测序对16S/18S/ITS等序列进行测序。可以同时检测样本中的优势物种、稀有物种及一些未知物种的检测，获得样本的微生物群落组成以及相对丰度。 相信关注我们的小伙伴对此并不陌生。 这次我们整合了大家平时会遇到的一些问题，在原有的基础上对报告进一步完善。 ...
- 置顶 · [转载]多快好省的宏基因组研究技巧 — 资深专家分享
- 谷禾健康 原创 近年的研究热点集中于环境和生物体相互作用的微生物群体，而大量复杂的微生物群体存在培养困难，构成复杂（包括细菌、古菌、真菌、原生生物、病毒甚至小型真核生物）。因此 如何用高通量精准的了解这些群体的构成，基因功能分布以及具体的表达活性和代谢状况 成为首要问题。 高通量测序技术 ...
- 置顶 · [转载]微生物多样性测序结果如何看？
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- 原文 如何读懂和利用你的微生物多样性测序结果？ 谷禾健康 原创 做过16s测序的小伙伴们都知道 测完之后会拿到一份结果报告 但这并不代表可以开始写文章了 看似一大堆数据图表却不知如何下手 这是很多人头疼的地方 那么怎样给报告中的数据赋予灵魂 让它真正成为对你有帮助的分析呢？ 今天我们来详细解 ...
- 最新研究进展 | 行为和神经退行性疾病中的肠道微生物分子
- 越来越多的证据表明，肠道微生物组会影响大脑的发育和功能。肠脑连接可能是由胃肠道中产生的各种微生物分子介导的，这些微生物分子随后会渗透到许多器官，包括大脑。 动物模型研究确定了从肠道细菌传播到大脑的分子线索，这些线索可能影响神经功能和/或神经发育和神经退行性疾病。 本文描述了已知或疑似神经调节活性 ...
- [转载]时间本身成为一种资源，微生物可以利用它进入新的栖息地
- 谷禾健康 微生物需要能源和细胞构成的材料。他们还需要使用液态水来达到自然条件，并且细胞损伤率要低于修复。当缺乏资源和自然条件时，微生物通常会进入某种形式的 休眠状态 （例如，通过停止细胞分裂，减慢新陈代谢速度或形成内生孢子），直到它们再次生长。例如，在晚上，营养养分等待太阳回来。在冬季，土壤微生物 ...
- [转载]细菌拮抗作用在细菌生活中的核心作用
- 谷禾健康 大多数细菌可能存在或至少有一部分时间处于单细胞状态。在这种 单细胞 状态下，细菌将更 容易受到一系列威胁 ，包括其周围环境的物理或化学性质的简单波动，更容易受到更直接的生物威胁，如抗生素、噬菌体、拮抗细菌，甚至是捕食性单细胞真核生物。因此，每一个细菌细胞都必须具备应对这种威胁的能力，微米尺 ...
- [转载]宏基因组的一些坑和解决方案
- 近年来，随着测序技术的发展，对微生物群（微生物组）的研究逐渐加深，研究热点越来越多集中于环境和生物体相互作用的微生物群。加之测序成本降低，分析技术不断提升，都使得宏基因组测序技术得到广泛应用。 为什么要做宏基因组 宏基因组相对16S来说其物种分辨率会更高，随着物种测序完成越来越多，数据库更加完善 ...
- [转载]城市化减少了空气中微生物，这对我们的健康意味着什么？
- 背景 目前，全球一半以上的人口居住在城市，到2050年，这一比例预计将增加到70％。 城市为人类带来了各种好处（例如，更大的就业，教育机会以及接触多种文化和食物的机会），但会影响我们与自然的互动。 重要的是，空气质量，建筑物密度，植被和运输路线等城市特征可能会影响健康，部分原因是改变了环境微生物群落（ ...
- [转载]微生物群对三大过敏性疾病发展的影响
- 在前一篇文章 生命早期微生物接触和过敏风险：如何预防 ，我们已经了解了微生物与过敏之间千丝万缕的联系。从构建微生物开始，到影响微生物的因素，过敏机制的阐述以及预防过敏的措施等都有了基本的认识。 本文将对微生物在过敏性疾病（食物过敏、特异性皮炎、哮喘）中的作用进行逐一介绍，尤其是微生物在儿童食 ...
- [转载]宏观生态规律如何应用于描述微生物群落的多样性和变化
- 宏观生态学中研究最多的模式是物种分度分布(SAD)，它被定义为具有给定丰度的物种的比例。研究中虽然对SAD进行了高度的研究和表征，但往往忽略了三个不同而独立的变异源对其的影响:采样噪声、个体物种丰度的波动和物种间丰度的变化。最近，发表在《Nature Communications》的一篇文章使用来自许多不同环境的微生物群落的纵 ...
- [转载]肠道菌群的恢复力：定义，与健康的关系以及干预策略
- 谷禾健康 肠道菌群是健康和疾病的新领域。不仅许多疾病都与微生物群落紊乱有关，而且越来越多的研究指出了其因果关系。在目前我们所知的情况下，很难定义什么是健康的微生物群，这主要是由于个体间的 高度可变性 。那么，“弹性菌群”可用作健康菌群的替代物。此外，肠道菌群是最容易受到环境变化和损害的“器官” ...
- 生命早期微生物接触和过敏风险：如何预防
- 谷禾健康 过敏 在日常生活中越来越常见，包 括哮喘，食物过敏，过敏性鼻结膜炎，特应性皮炎 等，是全球范围内最普遍的慢性炎症性疾病。 最近的证据表明，除了遗传易感性，现代化导致的生活方式的改变也发挥了重要作用。其中包括剖腹产的增加，生命早期使用抗生素的情况增加，西方化饮食和肥胖的发展 ...
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