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- 置顶 · 升级版|16srRNA微生物多样性测序报告解读
- 微生物多样性测序（扩增子测序）是基于二代高通量测序对16S/18S/ITS等序列进行测序。可以同时检测样本中的优势物种、稀有物种及一些未知物种的检测，获得样本的微生物群落组成以及相对丰度。 相信关注我们的小伙伴对此并不陌生。 这次我们整合了大家平时会遇到的一些问题，在原有的基础上对报告进一步完善。 ...
- 置顶 · [转载]多快好省的宏基因组研究技巧 — 资深专家分享
- 谷禾健康 原创 近年的研究热点集中于环境和生物体相互作用的微生物群体，而大量复杂的微生物群体存在培养困难，构成复杂（包括细菌、古菌、真菌、原生生物、病毒甚至小型真核生物）。因此 如何用高通量精准的了解这些群体的构成，基因功能分布以及具体的表达活性和代谢状况 成为首要问题。 高通量测序技术 ...
- 置顶 · [转载]微生物多样性测序结果如何看？
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- 原文 如何读懂和利用你的微生物多样性测序结果？ 谷禾健康 原创 做过16s测序的小伙伴们都知道 测完之后会拿到一份结果报告 但这并不代表可以开始写文章了 看似一大堆数据图表却不知如何下手 这是很多人头疼的地方 那么怎样给报告中的数据赋予灵魂 让它真正成为对你有帮助的分析呢？ 今天我们来详细解 ...
- [转载]肠道有害菌——脱硫弧菌属(Desulfovibrio)
- Desulfovibrio ， 脱硫弧菌 ，也被称为硫酸盐还原菌（SRB）属于变形菌门。这类细菌比较受关注，其中一个重要原因是这组细菌可以“呼吸” 硫酸盐而不是氧气 。由于 硫化氢(H 2 S) 的产生，SRB 被认为会对肠道上皮具产生毒性， 导致胃肠道疾病 。 脱硫弧菌属 无处不在 ，可以在土壤、水和污水中以及动物和人类的消 ...
- [转载]肠道微生物群：环境污染物毒性的主要参与者？
- 随着工业革命的发展，城市化进程的加快和经济的发展导致 能源消耗和废物排放 激增，在过去的几十年里， 环境污染物 已成为一种日益普遍的 健康危害 。 最近的研究还表明， 人类微生物组 可以 代谢 环境化学物质，进而可能会受到化学物质暴露的影响。 这种直接相互作用表明，在 风险评估 中可能需要 考虑微生物 ...
- [转载]肠道重要菌属——Akkermansia Muciniphila，它如何保护肠道健康
- 嗜粘蛋白-阿克曼氏菌 （ Akkermansia muciniphila ， A.muciniphila )，简称为 AKK ，于 2004 年发现，是一种从 人类粪便 中分离出来的椭圆形革兰氏阴性细菌。 该细菌以 荷兰微生物生态学家 Anton DL Akkermans 的名字命名，以表彰他对该领域的贡献。A. muciniphila 是人类肠道共生菌，并可以依靠肠 ...
- [转载]肠道菌群与蛋白质代谢
- ↑出现以上症状，可能是 身体缺乏蛋白质的信号 。 ★ 蛋白质有多重要？ 蛋白质不仅是构建人体组织的主要原料，而且对新陈代谢 至关重要 。 膳食蛋白质 及其代谢产物 氨基酸 是人类的 必需营养素 。 蛋白质提供能量，调节代谢；我们的 皮肤、骨骼、毛发 都有它的参与；当然 免疫系统 也少不了它。 ★ ...
- [转载]运动如何影响肠道微生物群，如何正确运动
- 运动 对心肺健康、肌肉力量、葡萄糖代谢、免疫系统和心理健康有 影响 。新的横断面研究证据表明， 运动锻炼 与 肠道微生物群 组成之间可能存在 密切关联 。 干预研究 支持锻炼对肠道微生物群的 有 益影响 。 纵向研究 表明，经常 中等强度的耐力运动 对肠道微生物产生 最有益 的影响，但是不同类型的 运动训练 ...
- [转载]如何通过喂养菌群产生丁酸调节人体健康
- 我们知道肠道菌群代谢产生短链脂肪酸， 丁酸 是短链脂肪酸之一，它支持消化系统健康和疾病预防， 地位不容小觑 。 丁酸作为一种有效的 调节因子 ，是宿主-微生物串扰的关键介体。本文整理了丁酸盐的特性，探讨其健康益处及改善健康的 潜力 。 01 丁酸盐 肠道菌群消化膳食纤维，并将它们转化为多种有 ...
- [转载]肠道核心菌属——普拉梭菌（Faecalibacterium Prausnitzii），预防炎症的下一代益生菌
- 本文原创：谷禾健康 Faecalibacteriumprausnitzii （F.prausnitzii） ， 普氏栖粪杆菌，又名：普拉梭菌 ，是人类肠道菌群中最重要的细菌之一，占健康人粪便样本中检测到的细菌总数的5-15%， 是丁酸的重要生产者之一， 具有 抗炎 作用 ， 维持 细菌酶 的活性， 保护消化系统 免受肠道病原体的 ...
- [转载]肠道核心菌属——萨特氏菌（Sutterella）
- Sutterella ——萨特氏菌 Sutterella 是一种革兰氏阴性杆细菌，主要从肠道和胃肠道感染中分离出来的。其属的成员已从横膈膜下方的人类感染中分离出来。 来源：spectrumnews 01 了解 Sutterella Sutterella （萨特氏菌）是 变形菌 门最丰富的菌之一，是一种厌氧或 微需氧的、耐 ...
- [转载]RESCRIPt：序列分类参考数据库管理工具
- 分类分析的研究，依赖于高质量的序列分类参考数据库，然而，目前已有记录公共序列数据库中出现错误，这些错误可能导致下游结果出错。 不同的参考数据库 对生物数据的分类结果 差别很大 ，但 缺乏客观评价 单个数据库质量的 标准 。 有人选择自行构建特定于环境的数据库，但生成这样的数据库在技术上具有 挑战性 ，导致 ...
- [转载]肠道菌群健康检测报告——常见问题解析
- 本文原创：谷禾健康 在持续的肠道菌群检测实践过程中，我们收到很多新的问题反馈和对肠道菌群检测在具体问题中的疑问。在此谷禾基于长期和大规模样本群的经验以及实验分析，对部分常见问题进行汇总和整理。 一次肠道菌群检测好比一场健康考试，你拿到报告的那一刻，等同于拿到了你考的那张卷子，那么你 ...
