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- 置顶 · 升级版|16srRNA微生物多样性测序报告解读
- 微生物多样性测序（扩增子测序）是基于二代高通量测序对16S/18S/ITS等序列进行测序。可以同时检测样本中的优势物种、稀有物种及一些未知物种的检测，获得样本的微生物群落组成以及相对丰度。 相信关注我们的小伙伴对此并不陌生。 这次我们整合了大家平时会遇到的一些问题，在原有的基础上对报告进一步完善。 ...
- 置顶 · [转载]多快好省的宏基因组研究技巧 — 资深专家分享
- 谷禾健康 原创 近年的研究热点集中于环境和生物体相互作用的微生物群体，而大量复杂的微生物群体存在培养困难，构成复杂（包括细菌、古菌、真菌、原生生物、病毒甚至小型真核生物）。因此 如何用高通量精准的了解这些群体的构成，基因功能分布以及具体的表达活性和代谢状况 成为首要问题。 高通量测序技术 ...
- 置顶 · [转载]微生物多样性测序结果如何看？
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- 原文 如何读懂和利用你的微生物多样性测序结果？ 谷禾健康 原创 做过16s测序的小伙伴们都知道 测完之后会拿到一份结果报告 但这并不代表可以开始写文章了 看似一大堆数据图表却不知如何下手 这是很多人头疼的地方 那么怎样给报告中的数据赋予灵魂 让它真正成为对你有帮助的分析呢？ 今天我们来详细解 ...
- [转载]一文了解 | 革兰氏阳性和阴性菌区别，致病差异，针对用药
- 革兰氏阳性和阴性菌 在日常生活中，我们常常会看到 药物或抗菌 产品 适应症 会这样写到，对革兰氏阳性菌有效，对革兰氏阴性菌敏感，或者说对革兰氏阴性菌有效，对革兰氏阳性菌无效。可能很多人不是很清楚或搞不懂二者的区别。 本文主要介绍 革兰氏阳性和阴性菌 ，它们的区别，代表性菌种以及针对用药等。 1884年 ...
- [转载]细菌如何交流和占地盘——细菌的群体感应和生物膜
- 有人在的地方就有江湖，这也同样适用于细菌。 单个细菌的行动往往只是徒劳，然而当它们在一起的时候，集体行动的能力令人刮目相看。 细菌使用化学物质作为它们的“语言” ，使用化学通讯来区分自己的物种和其他物种。 实际上它们看不到，并不知道彼此在那里，但它们可以测量化学物质的浓度。 当这些化 ...
- [转载]微生物学的发展——我们在哪里，我们要去哪里？
- 写在前面 本文是谷禾健康微生物团队参考自英国大不列颠国家图书馆，美国微生物学会于 2003 年 在南卡罗来纳州查尔斯顿举办的一次微生物学 座谈会， 以及哈佛医学院微生物学系教授 罗伯托·科尔特 （Roberto Kolter）给Annual Review 期刊成立75 周撰写的微生物特刊等 综合 整理的，我们不是历史学家，更称不上微生 ...
- [转载]肠道核心菌属——巨单胞菌属，不同人群差异大
- 巨单胞菌属 （Megamonas） 巨单胞菌属 （Megamonas）， 厚壁菌门，梭状芽孢杆菌目的革兰氏阴性菌，发酵各种碳水化合物， 终产物是乙酸、丙酸和乳酸 。分离于人、动物和家禽的肠道。 巨单胞菌作为肠道核心种，可能是 亚洲人种 的特征。与炎症性肠病、结直肠癌、强制性脊柱炎（AS）、自闭症谱系障碍（ASD）、肥 ...
- [转载]认识变形菌门，变形菌门扩张的原因和健康风险
- 微生物群代表宿主肠道中存在的 整个 微生物群 。肠道内细菌界的“贫富差距”非常大，和人类社会创造的大部分的财富都流向少部分人口的现实类似，只有少数 几十种的细菌分布在近乎90%的人群中 。换句话说，大部分细菌都只能在特定的环境中生存，只有少数细菌适应能力超强， 这可能也是我们需要重点关注的对象 。 ...
- [转载]肠道核心菌属——粪球菌属（Coprococcus）
- 粪球菌属（Coprococcus） 是厚壁菌门毛螺菌科重要成员，是肠道重要的菌属，菌种大部分从粪便中分离出来，积极发酵碳水化合物，是和Faecalibacterium prausnitzii一样， 丁酸的重要生产者之一 。粪球菌可用作评估人体胃肠道健康状况的微生物生物标志物，Coprococcus属的细菌可能有助于 抑制免疫反应 ， 降低过 ...
- [转载]如果你要补充益生菌 ——益生菌补充、个体化、定植指南
- 最近关于“益生菌”的风很大，我们越来越容易从各种渠道听到关于补充益生菌的科普，但依然一知半解。 我们每个人都需要补充益生菌吗？ 不同益生菌有什么不同，如何选择？ 为什么有的人补充有效，有的人无效？ 益生菌真的能定植吗？与什么因素有关？ ..... 本文我们来逐一解答这些问题。 01 每个人 ...
- [转载]肠道核心菌属——毛螺菌属（Lachnospira）
- 毛螺菌属 （Lachnospira），属于厚壁菌门， 毛螺菌科 （Lachnospiraceae），该菌属存在于大多数 健康人的肠道里 ，可能是一种潜在的 有益菌 ，参与多种碳水化合物的代谢， 尤其水果蔬菜中的果胶 （一种复杂的膳食纤维和益生元）的能力很强，发酵导致 乙酸和丁酸 的产生为宿主提供能量的主要来源。 图片来源：micro ...
- [转载]菌群多样性是如何形成的，与健康的关系，如何改善？
- 菌群多样性 ✦ 关于菌群多样性，小伙伴们常会问到： 菌群多样性是如何形成的？ 菌群多样性越高越好吗？ 它与健康的关系如何？ 该怎么去改善呢？ ...... ✦ ✦ 本期推文就为大家统一解答这类问题。 本文要点 1. 菌群多样性很重要，维持菌群稳定和有效抵御致病菌入侵 ...
- [转载]梭杆菌属Fusobacterium——共生菌、机会致病菌、致癌菌
- 梭杆菌属 （Fusobacterium），是梭菌门最主要的菌属， 厌氧革兰氏阴性 细菌，与拟杆菌属、普氏菌属、卟啉单胞菌属一样都是 医学上重要 的厌氧革兰氏阴性 杆菌 。 CNRI/SCIENCE PHOTO LIBRARY 梭杆菌属是人类和动物的身体 共生菌 之一，主要定植在人类和动物的 粘膜 中，两个最主要的聚集地是 口 ...
