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- 置顶 · 升级版|16srRNA微生物多样性测序报告解读
- 微生物多样性测序（扩增子测序）是基于二代高通量测序对16S/18S/ITS等序列进行测序。可以同时检测样本中的优势物种、稀有物种及一些未知物种的检测，获得样本的微生物群落组成以及相对丰度。 相信关注我们的小伙伴对此并不陌生。 这次我们整合了大家平时会遇到的一些问题，在原有的基础上对报告进一步完善。 ...
- 置顶 · [转载]多快好省的宏基因组研究技巧 — 资深专家分享
- 谷禾健康 原创 近年的研究热点集中于环境和生物体相互作用的微生物群体，而大量复杂的微生物群体存在培养困难，构成复杂（包括细菌、古菌、真菌、原生生物、病毒甚至小型真核生物）。因此 如何用高通量精准的了解这些群体的构成，基因功能分布以及具体的表达活性和代谢状况 成为首要问题。 高通量测序技术 ...
- 置顶 · [转载]微生物多样性测序结果如何看？
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- 原文 如何读懂和利用你的微生物多样性测序结果？ 谷禾健康 原创 做过16s测序的小伙伴们都知道 测完之后会拿到一份结果报告 但这并不代表可以开始写文章了 看似一大堆数据图表却不知如何下手 这是很多人头疼的地方 那么怎样给报告中的数据赋予灵魂 让它真正成为对你有帮助的分析呢？ 今天我们来详细解 ...
- [转载]自学 R 语言的十条干货技巧分享
- 统计和科学编程已迅速成为科学中的一项必要技能，而这一般都需要用到—— R语言 。 R语言以其 简单易学、免费开源 的特性，正在各个领域发挥着越来越重要的作用。 由于其强大的 统计计算 和 数据可视化 两大功能，可以说在生信领域， R语言是干活的法宝。 精确绘制各种非常漂亮的图 各种各样的数据运算、清 ...
- [转载]通过肠道菌群了解维生素的摄入水平
- 在谷禾肠道菌群健康检测中，我们会看到结果报告中关于维生素的评估如下： 摄入水平建议保持在70-80分之间最佳，如果单项指标 低于5 表明摄入比例在人群中属于最低的5%，评估为 缺乏 ，如上图中维生素B2； 低于15 评估为 偏低 ，如上图中叶酸； 达到或超过95 则表明该项指标可能摄入比例 偏高 ， ...
- [转载]生命早期肠道微生物群与儿童呼吸道疾病之间的关联
- 儿童呼吸系统疾病，包括呼吸道感染、反复喘息和哮喘，是儿童及其以后年龄发病和死亡的 重要原因 。 而哮喘是其中比较典型的一种，哮喘是全球最常见的慢性疾病之一，是一种复杂的、异质性的免疫介导的紊乱集合，以 气道重塑 和 慢性气道炎症 为特征。 ▸哮喘的危险因素 哮喘的发病机制仍不 ...
- [转载]人生的镜像-菌群人生，从出生到死亡的菌群演替
- 每个人的一生都会经历很多，从 出生到长大 ， 健康到衰老疾病 。你的出生、遗传、家庭环境、很大程度上决定的人生起点，日常的饮食、行为习惯决定你的身体成长，一些不同的选择或意外的事件又会让人生有很多起伏和不同。 每个人的菌群和我们的人生一样也是独一无二的，我们菌群的特点反映着 不同人各自生活的烙印 。从母 ...
- [转载]以机器学习为框架搭建的能快速检索并获取宏基因组学已发表文章的元数据
- 全基因组鸟枪DNA测序已成为 评估广泛环境样本中微生物含量 的有力工具。宏基因组学分析的出现使得在 特定生物群 中发现的微生物群的系统发育和功能分析成为可能，而无需培养。样本之间的荟萃分析可以揭示对环境条件或可能对健康或疾病负责的‘社区候选成员’的特定适应。 然而，为了在观察到的表型和成分变化之间建 ...
- 肠道核心菌属——经黏液真杆菌属（Blautia），炎症肥胖相关的潜力菌
- Blautia （经黏液真杆菌属） Blautia是一种最近发现的细菌属，是将几种丰富的胃肠道细菌归类，这些细菌以前属于Ruminococcus属。基于表型和系统发育分析，梭菌属和瘤胃球菌属中的一些物种也已被重新归类为Blautia. Blautia作为 毛螺菌科 的一个属，自成立以来，因其对 缓解炎症性 ...
- [转载]妇科癌症中的肠道菌群：病因、治疗潜力
- 宫颈癌、卵巢癌和子宫内膜癌 是最常见的妇科癌症。根据最新的全球癌症数据，女性宫颈癌的发病率和死亡率分别居第四位和第六位，而卵巢癌的死亡率居第五位，居 妇科恶性肿瘤之首 。 此外，随着人类生活水平的提高 ，肥胖、内分泌失调、环境污染 也可能 增加 妇科癌症的 发病率 和 死亡率 。 研究表明，妇科恶性肿 ...
- [转载]环境污染物通过肠脑轴影响心理健康，精神益生菌或将发挥重要作用
- 在这个充满压力、紧张和焦虑的快节奏世界中，人人都容易患上许多身心疾病。 根据世界卫生组织 (WHO) 的数据，世界上每 8 人中就有 1 人患有精神障碍，其中焦虑症和抑郁症最为常见。尤其经历疫情，仅2020年，全球重度抑郁症患者增加27.6%（95%不确定区间（UI）：25.1-30.3），焦虑症患者增加25.6%（95%不确定区间：23.2-28 ...
- [转载]膀胱癌、炎症和微生物组
- 膀胱癌主要是 老年人 的疾病，约75%的新诊断发生在65岁以上的患者，约45%发生在75岁以上的患者。膀胱癌对男性和女性的影响比例为 3:1 ，但随着 年龄的增长 ，男性和女性的 发病率 都 显著增加 。 年龄增长 与膀胱癌的发病率和 死亡率升高有关 。高龄还与慢性炎症标志物升高以及肠道和尿液 微生物群紊乱有关 。 ...
- [转载]谷物调节肠道菌群，促进代谢健康
- 饮食 可以 调节人体肠道微生物群 的 组成 和 功能 ，以维持宿主微生物群的互惠共生。 谷物 富含特定的 功能元素 ，是 维持 人类健康的 重要膳食成分 。谷物可以 改变 肠道微生物群，并可能 改善 能量和葡萄糖稳态，干扰宿主能量稳态、食欲、血糖调节、胰岛素敏感性和宿主代谢的调节。 什么是全谷物 全谷物 ...
