博文
- 置顶 · 升级版|16srRNA微生物多样性测序报告解读
- 微生物多样性测序（扩增子测序）是基于二代高通量测序对16S/18S/ITS等序列进行测序。可以同时检测样本中的优势物种、稀有物种及一些未知物种的检测，获得样本的微生物群落组成以及相对丰度。 相信关注我们的小伙伴对此并不陌生。 这次我们整合了大家平时会遇到的一些问题，在原有的基础上对报告进一步完善。 ...
- 置顶 · [转载]多快好省的宏基因组研究技巧 — 资深专家分享
- 谷禾健康 原创 近年的研究热点集中于环境和生物体相互作用的微生物群体，而大量复杂的微生物群体存在培养困难，构成复杂（包括细菌、古菌、真菌、原生生物、病毒甚至小型真核生物）。因此 如何用高通量精准的了解这些群体的构成，基因功能分布以及具体的表达活性和代谢状况 成为首要问题。 高通量测序技术 ...
- 置顶 · [转载]微生物多样性测序结果如何看？
- 隐藏
- 原文 如何读懂和利用你的微生物多样性测序结果？ 谷禾健康 原创 做过16s测序的小伙伴们都知道 测完之后会拿到一份结果报告 但这并不代表可以开始写文章了 看似一大堆数据图表却不知如何下手 这是很多人头疼的地方 那么怎样给报告中的数据赋予灵魂 让它真正成为对你有帮助的分析呢？ 今天我们来详细解 ...
- [转载]探秘音乐疗法——基于音乐的喂养环境对小鼠肠道菌群影响的研究
- 音乐对身心的影响 近年来， 环境 和 动物生理 及 心理 的相关研究越来越多。环境因素的丰富性和多样性是 改善动物生理 和 心理状态 的重要研究参数。 环境因素指的是正常环境，在这种环境中，动物通过获得 环境激励 以做出有益的增强，使它们能够正常表达其行为和心理活动，从而 改善 健康状况 和 生长性能 。 ...
- [转载]基于短核苷酸序列频率构建细菌系统发育树
- 目前，原核生物的系统发育分类 依赖于16S rRNA基因序列 ，这种序列在细菌中广泛存在且高度保守，但即使16S rDNA测序的结果显示某些细菌间序列相似性≥99%，但它们 仍然不能被归为同一物种 。因为基因序列中的一些保守区域并不一定代表真正的进化历史，水平基因转移也可能会影响分析结果。 为此研究人员开 ...
- [转载]生物信息学——用好源代码的技巧与心法
- 如果你是一名科研人员，在研究的过程中需要用到代码，那么你可能不需要像专业码农那样从头到尾一句一句去写完整的，而是可以将网上的一段符合应用场景的现成代码拿过来直接用。 这听起来是不是很简单？然而实际上... 目前，虽然学术界有资源可以用来编写更好的代码，但很少关注使用他人的代码可能遇到的问题 ...
- [转载]粪菌移植——一种治疗人体疾病的新型疗法
- 粪菌移植 是一项近年来备受关注的 医疗技术 ，它涉及将健康捐赠者的 粪便物质 转移至 患有疾病或障碍 患者的 胃肠道 。 简单来说就是选择健康合适的人粪便，通过科学方法提取出 有用的微生物 ，去除有害与无用的部分，然后制成制剂，给病人口服或者直接注入肠道，目的是恢复健康的 肠 ...
- [转载]长期封闭环境中与积极情绪相关的肠道菌群
- 太空环境，尤其是长期封闭的 隔离环境 ，会导致机组人员 长期处于慢性应激状态 。心理健康风险是载人深空探索和长期封闭环境中最 严重复杂 的风险之一。 近年来，随着微生物群-肠-脑轴研究的深入，越来越多证据表明， 微生物群-肠-脑轴 在调节大脑功能方面发挥着 关键 作用，尤其是在 情绪处理和行 ...
- [转载]酒精和肠内外健康：有帮助还是有害？
- 酒精与健康 饮酒作为一种特殊的文化形式，在我们国家有其独特的地位，在几千年的发展中，酒几乎渗透到日常生活、社会经济、文化活动之中。 据2018年发表的《中国饮酒人群适量饮酒状况》白皮书数据显示，中国饮酒人群高达6亿。酒精暴露是一种环境刺激，可显著改变许多 生理、心理以及周围和中枢神经系统过程。从 ...
- [转载]什么是胆汁酸，其与肠道微生物互作如何影响人体健康
- 胆汁酸是一种 代谢胆固醇 的物质，它具有 两个亲和性不同 的区域，即一部分能够与 水分子 相互作用（亲水），而另一部分则不能与水分子相互作用（疏水）。 由于拥有这种两亲性质，胆汁酸能够在生物体内与胆固醇等 脂类物质结合 并形成混合物，从而起到 降低血液中胆固醇 水平的作用。 胆汁酸不仅是 代谢胆 ...
- [转载]肠道核心菌属——Lachnoclostridium，不可忽视的菌
- Lachnoclostridium 属是一类 革兰氏阳性 菌， 专性厌氧 、形成孢子、能动的细菌，属于 Clostridiales 目、 Lachnospiraceae 科、 Firmicutes 门。该属最初被描述为 Clostridium phytofermentans ，后来被重新分类为 Lachnoclostridium 属。 Lachnoclostridium 属包括来自 Lachnospiraceae 科和几个梭菌簇 ...
- [转载]消化道炎症 | 细菌蛋白酶失调的作用
- 肠道蛋白酶 蛋白水解平衡失调 通常与 疾病有关 。例如丝氨酸蛋白酶和基质金属蛋白酶参与多种生物过程，尤其是 炎症反应 。 胃肠道拥有数以万亿计的微生物 ，并暴露于 高水平的蛋白酶 。研究表明 蛋白酶在维胃肠道稳态中的关键作用 ，它们的上调会导致组织损伤和炎症 。 基质金属蛋白酶 (MMP) 被 ...
- [转载]胸闷？疲劳？气喘？恶心？心力衰竭的症状及肠道相关干预措施
- 心力衰竭 Heart Failure（HF） 心力衰竭是一种严重的心血管疾病，其特点是 较高的发病率 和死亡率，同时也会带来高昂的医疗成本。 一般都认为心力衰竭是老年人的疾病，但其实心力衰竭已经呈现 年轻化 趋势。 以上症状都有可能与早期心力衰竭相关。发生心力衰竭时， 血液通常会回流 并导致液体在 肺 ...
