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数量生态学笔记||Q模式
周运来 2018-7-22 17:42
好了,回到我们《数量生态学》课堂上来。 数量生态学笔记||绪论 数量生态学笔记||数据探索 数量生态学笔记||物种数据转化 在进行了简单的数据探索之后,在对数据进行了符合模型的计算之后,是不是马上可以绘制Nature Science上面的高颜值图表了呢?在这之前我们还有一段路线要走,要记住我们关注的始终是 生态 ...
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当宏基因组遇见宏蛋白组
周运来 2018-7-18 22:17
好了,让我们持续关注肠道微生物菌群(gut microbiota ,GM)。 众所周知,目前研究宏基因组最常用方法的是扩增子、和全基因组测序。虽然方法简单高效,但缺点也是显示易见的。比如只针对DNA为研究对象,这样无法判断研究对像是否还活着,连上百万年的化石都会有DNA保存下来可以测序。 要想逼近真想我们还有很长的路下 ...
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数量生态学笔记||物种数据转化
周运来 2018-7-16 21:58
其实在上节课 数量生态学笔记||数据探索 中我们已经简单接触了数据的转化,我们为了使不同刚量的数据能在一起比较使用了标准化。在数据分析的过程中,经常要根据分析的需要对数据进行转化,以符合模型的内在需要。 要知道我们采集来的一手数据有时会带有我们的 采集痕迹 有时这种痕迹可能会掩盖问题的实质。我们常常 ...
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数量生态学笔记||数据探索
周运来 2018-7-16 20:03
上节课 数量生态学笔记||绪论 我们简单了解《数量生态学》的基本内容,特别介绍了书中用到的数据集Doubs、甲螨数据集。关于R并未做过多的介绍,因为这是一本生态学的书。但是关于学习方法我推荐一种 卡片学习法 : 将知识点整理在一个小的可用随身携带的卡片上,可以随时翻阅,可以建立链接。也就是学习就像拼图,在 ...
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KEGG分析工具:pathview基本操作
周运来 2018-7-12 22:48
什么是KEGG KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)是系统分析基因功能、基因组信息数据库,它有助于 研究者把基因及表达信息作为一个整体网络进行研究 。KEGG将基因组信息和高一级的功能信息有机地结合起来,通过对细胞内已知生物学过程的计算机化处理和将现有的基因功能解释标准化,对基因的功能进行系统化 ...
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红海水体环境微生物红基因组(泛读)
周运来 2017-4-4 21:26
Metagenomic covariation along densely sampled environmental gradients in the Red Sea. IF=9.328 红海水体环境微生物红基因组(泛读) 摘要 海洋微生物多样性是和物理化学指标共变的。例如,温度能够 在表面 的分类丰度上解释大约一半的全部 变异 。然而并明确的是,共变的模式是否会延续到较小的指 ...
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把生命浪费在美好的事物上
周运来 2016-6-5 09:43
18 May,2016 随来啦收到读者来信,运来菌受宠若惊。发表小小拙见,仅供参考,毕竟我们都有自己的生活情境。 运来菌,你好: 我是你的QQ好友Chandler(化名)。说来我们也算是陌生的朋友了,一直关注着你的空间动态和《随来啦》推送的文章,并且对于很多运来菌自己写的文章,我 ...
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导师送书啦!
周运来 2015-7-8 12:24
真心的希望各位大导们看了能给他们的学生配几本,或者各位科研新秀能自发地买几本。申明,我爸不是卖书的 。 1 、 《给研究生的学术建议 (英)鲁格,(英)彼得 著 ,彭万结 译 北京大学出版社》(英)鲁格,(英)彼得 著,彭万结 译 _ 简介 _ 书评 _ 在线阅读 - 当当图书 h ...
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