scRNA-seq拟时分析工具STREAM简介[附在线版]

周运来 2019-3-31 16:51

scRNA-seq数据分析想必大家都比较熟悉了，自2014年 nature biotechnology 提出单细胞拟时分析或称为轨迹分析（Trajectory）已经有五个年头了。除了经典的Monocle（只不过是一个R包）之外出现了许多应用方便的分析工具与算法，由我带大家认识一款在Linux（命令行版）和Windows（界面版）都可以使用的分析工具—— STREA ...

8156 次阅读|没有评论

环境与生态统计||探索性数据可视化

周运来 2019-1-12 11:08

探索性数据分析（Exploratory Data Analysis, EDA）是一门学问。在我们拿到数据之后的第一冲动就是拿来建模，得出一个函数来描绘我们希望阐明的自然现象。然而，这只是一个比较浪漫的想法而已。所有统计模型都是基于一个或多个关于数据分布和关系特征的假设。学习统计学方法时，关键技巧就是有统计假设的意识和评价是否满 ...

3916 次阅读|没有评论

环境与生态统计||探索性数据分析

周运来 2019-1-12 11:07

rm(list=ls()) source(D:\\Users\\Administrator\\Desktop\\RStudio\\Environmental_and_Ecological_Statistics_with_R\\DataCode\\Code\\FrontMatter.R) ################## ###Chapter3### ################## plotDIRch3-paste(plotDIR,&nb ...

2311 次阅读|没有评论

环境与生态统计||置信区间的估计

周运来 2019-1-12 11:06

经典统计学的核心思想就是用样本（我们所能采集到的数据，如总磷浓度，TP）去估计总体（关于总体情况的描述）；总体的参数是未知的，不可测度或难以测度，注意它是固定了的数值； 我们采集了有限的TP，而且在前人研究的基础上已知一个生态系统中TP可以被近似为对数正态分布，那么剩下的工作就是要估计分布的对数均值和对 ...

4137 次阅读|没有评论

统计推断概述

周运来 2019-1-12 11:05

什么是统计推断 对于要做统计推断的人来讲，这个问题似乎显得多余，他们往往关心 怎样做统计推断 。这也许可以窥得发展中国家在经济增长中的一个弊端：知其然，不知其所以然。因为别人已经做出来了嘛，我管那么多干嘛，先做出来再讲！然而，核心科技我们还是要掌握的。 我们经常讲概率统计，概率统计，这并不是一个词 ...

15416 次阅读|没有评论

环境与生态统计||假设检验

周运来 2019-1-12 11:02

假设检验也叫显著性检验，是以小概率反证法的逻辑推理，判断假设是否成立的统计方法，它首先假设样本对应的总体参数（或分布）与某个已知总体参数（或分布）相同，然后根据统计量的分布规律来分析样本数据，利用样本信息判断是否支持这种假设，并对检验假设做出取舍抉择，做出的结论是概率性的，不是绝对的肯定或否定。 ...

6672 次阅读|没有评论

本页有 4 篇博文因作者的隐私设置或未通过审核而隐藏