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shell： 统计当前目录下文件数/文件夹数

2014-12-10 14:40

Linux下查看当前目录下文件的个数 ls -l | grep “^-” | wc -l 查看当前目录下文件的个数，包括子目录里的 ls -lR| grep “^-” | wc -l 查看某目录下文件夹（目录）的个数，包括子目录里的。 ls -lR| grep “^d” | wc -l 简要说明： ls -l 长列表输出该目录下文件信息(注 ...

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R的获取和安装

2014-12-4 17:50

R可以在CRAN(The Comprehensive R Archive Network)上免费下载。 Linux,Mac OS X和Windows都有相应编译好的二进制版本。 根据你所选择平台的安装说明进行安装即可。 另外，可以通过安装称为包（package）的可选模块（同样可从CRAN下载）来增强R的功能。 CRAN链接: http://cran.r-project.org/ &nb ...

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lncRNA的分析策略

2014-12-3 23:09

lncRNA 这两年可谓研究的热火朝天，各种基金申请，各种 lncRNA 最新研究铺天盖地袭来，这里我们就来说说 lncRNA 究竟都做了哪些研究？ 1 、差异表达筛选 通过lncRNA 芯片或 RNA-seq 测序等方法对多对疾病模型和对照样本组织进行 lncRNA 表达谱分析。 2 、生物信息分析 通过生物信息学的方法筛选出具 ...

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microRNA靶标预测数据库

2014-12-3 23:08

（ 1 ） miRbase ：众所周知的 microRNA 基因注释数据库。目前 miRBase 只提供了 microRNA 的靶标的预测软件的链接（如： PicTar ）。最新版本发布时间： 201 4 年 6 月。 网址： http://mirbase.org/index.shtml （ 2 ） starBase ：一个高通量实验数据 CLIP-Seq （或称为 HITS-C ...

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microRNA命名规范

热度 1 2014-12-3 23:07

一、 miRNA 的定义 miRNA(microRNA) 是一组由基因组编码的长度约 17 ～ 25 个核苷酸的非编码 RNA ，通过和靶基因 mRNA 碱基配对引导沉默复合体 (RISC) 降解 mRNA 或阻碍其翻译。 miRNA 在物种进化中相当保守，在植物、动物和真菌中发现的 miRNA 大部分在特定的组织和发育阶段表达。 ...

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DAVID使用教程

2014-12-3 23:03

DAVID 是一个生物信息数据库，整合了生物学数据和分析工具，为大规模的基因或蛋白列表（成百上千个基因 ID 或者蛋白 ID 列表）提供系统综合的生物功能注释信息，帮助用户从中提取生物学信息。 DAVID 目前的工具可以实现以下功能 1.识别富集的生物条目，尤其是GO 条目 2.发现功能相关的基因集合 ...

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