基因组分析软件汇总

熊朝亮 2015-8-15 20:08

******************************************【Mapping】***************************************** BFAST : A fast and accurate tool for mapping of short reads to reference sequences. BWA : A fast light-weighted tool that aligns short nucleotide sequences to a sequence databas ...

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ChIP-Seq分析流程

热度 1 熊朝亮 2014-12-3 22:44

背景介绍 染色质免疫共沉淀技术（Chromatin Immunoprecipitation），是一类通过将与特定蛋白质与其结合DNA序列共同沉淀下来研究其相互作用的方法，这一方法和测序技术结合起来，可以研究转录因子在基因组上的结合区域、特异性修饰的组蛋白位点以及其他DNA结合蛋白的基因组特异结合位点等表观遗传性学 ...

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从哪里可以获取chromsize文件？

熊朝亮 2014-12-2 17:01

通过UCSC可以获取chromsize文件，但是要注意版本(下面以hg19为例)： UCSC---Downloads---Human---hg19---Annotation database---chromInfo.txt.gz

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