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GDSC---肿瘤药物敏感性基因组学数据库

已有 2540 次阅读 2021-11-22 21:16 |个人分类:【数据库】|系统分类:科研笔记

GDSC(Genomics of Drug Sensitivity in Cancer):
https://www.cancerrxgene.org/
GDSC提供免费公开的肿瘤治疗基因组数据,致力于发现潜在的肿瘤治疗靶点以改善肿瘤治疗,是全球最大的同类型公共数据库。
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GDSC数据库支持化合物(药物)细胞系癌基因三种检索方式。化合物的相关信息由行业、学术合作伙伴或供应商处获取;癌基因组突变信息来自COSMIC数据库。

GDSC目前提供两个数据集:GDSC1是该网站上可用的原始数据集(2009-2015年间收集)的扩展。而GDSC2则基于改进的技术、设备和程序等所得的最新的数据(2015-至今)。例如:GDSC1使用DNA染料(Syto60),而GDSC2使用代谢测定法(Resazurin / CellTiter-Glo)来确定细胞活力。

GDSC2中已经重复了许多来自GDSC1的实验,官方建议使用GDSC2!【但实际选哪个用,由你自己决定,实际上有些基因的数据在GDSC1中有,在GDSC2中则不存在...】




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