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10月17日-20日,受会议主办方的邀请,Macrogen千年基因中国区CEO于越及动植物产品线副总监吴婷婷将已参加了“中国动物学会两栖爬行动物学分会2014年学术研讨会”并在会议上作学术报告。
中国大鲵基因组测序项目由千年基因与河南师范大学副校长徐存拴教授以科研合作的形式共同启动,千年基因全面负责娃娃鱼全基因组和转录组的测序及信息分析,双方共同负责测序数据的生物学意义挖掘及文章撰写。通过初步分析得知,中国大鲵基因组高达50Gb,是迄今为止所开展基全基因组测序最大的基因组,这将对测序和信息分析均带来较大挑战。千年基因将基于多年的国际大型基因组项目经验和文章发表经验为该项目制定最全面的解决方案,也在这次会议中与大家进行了交流。
在会议中,Macrogen千年基因中国区CEO于越及动植物产品线副总监吴婷婷为河南师范大学副校长徐存栓,中国科学院副院长张亚平院士等做了中国大鲵基因组测序研究进展的汇报,包括就中国大鲵基因组预估的方法,及其基因组大的原因等方面做了详细交流,并就项目后期计划所要开展的研究及分析做了深入探讨。在前期千年基因和徐存栓校长合作的基础上,张亚平院士加入基因组和转录组计划,三方达成协议,将继续在全基因组以及转录组上将增加更多的基因组shotgun测序数据和大片段文库测序数据,以及转录组数据的研究,针对大鲵占据特殊的进化地位、及肝脏再生等方面的独特的生物学问题进行深入的分析和探讨,并将相关研究结果做阶段性产出。下一阶段的研究工作考虑加入读长更长的PacBio RS II平台测序数据来跨越中国大鲵基因组中的重复序列区域甚至转座子序列等,同时会增加更多的大片段数据结合三代数据进行组装和scaffolding,从而为解析中国大鲵全基因组序列做最为全面的项目计划考虑。
本次会议由中国动物学会两栖爬行动物分会主办,在河南师范大学举行。会议网址:http://czs.ioz.cas.cn/xwdt/xhtz/201409/t20140924_258276.html。
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