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人类蛋白质组生物通
郑俊娟 2014-6-4 21:19
Nature 509 (2014年5月29日) 生物通 www.ebiotrade.com 人类基因组草图已经发表十年多了,现在仍然没有与之直接相应的人类蛋白质组草图。但在本期Nature上,两个小组发表了对人体组织、体液和细胞所做的质谱分析,标绘了人类蛋白质组的绝大部分。Akhilesh Pandey及同事识别出17,294个蛋白编码基因,并通过表达分析提供 ...
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Converting Genome Coordinates From One Version To Another
热度 1 郑俊娟 2014-5-26 22:28
Some recent posts reminded me that it might be useful for us to review the options for converting between genome coordinate systems. This comes up in several contexts. Probably the most common is that you have some coordinates for a particular version of a reference genome and you w ...
3507 次阅读|2 个评论 热度 1
bed format bed格式
郑俊娟 2014-5-23 15:25
bed文件是ucsc 的genome browser的一个格式,3+9=12列,前三列是基本列,后九列是附加列 下面概要介绍一下: 基本列 1. chrom #chrom 或者scaffold 名称 2. chromStart #feature在chrom中的起始位置(前坐标),chrom的第一个碱基的坐标是0,chromStart如果等于2,其实表示的是第三个碱基,featur ...
个人分类: NCBI|6925 次阅读|没有评论

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