juan503949201的个人博客分享 http://blog.sciencenet.cn/u/juan503949201

博文

彻底搞清楚promoter, exon, intron, and UTR

已有 20943 次阅读 2014-5-8 13:46 |个人分类:Study everyday|系统分类:科研笔记

   •启动子: RNA聚合酶特异性识别和结合的DNA序列。promoter自然不属于intronExon的任何一个,属于noncodingsequence

        •noncoding RNA是现在研究的热点之一。我们常见的MiRNA,SiRNA,antisense RNA tech,这些都是属于ncRNA的范围。只要你在进一步问下:这些RNA是哪里来的?你就知道部分答案,跟那些看似跟编码蛋白没有关系的DNA序列有关系。这部分DNA有个统称就junk DNA,垃圾DNA或者冗余DNA,他们编码的RNA就属于 ncRNA.RNAi就是迄今最经典的ncRNA功能典范。

        •An exon is asequence of DNA that is expressed (transcribed) into RNA and then often, butwith many noteworthy exceptions[1] , translated into protein. Adjacent exons maybe separated by an intron, which is later removed from the RNAtranscript via the splicing mechanism. (From Wikipedia)

        •UTRUntranslatedRegions)即非翻译区,是信使RNAmRNA)分子两端的非编码片段。  

        •5'-UTRmRNA起点的甲基化鸟嘌呤核苷酸帽延伸至AUG起始密码子,3'-UTR从编码区末端的终止密码子延伸至多聚A尾巴(Poly-A)的末端。

   转录(Transcription)是遗传信息从DNA到RNA的转移。即以双链DNA中的一条链为模板,以ATP、CTP、GTP和UTP4种核苷三磷酸为原料,在RNA聚合酶催化下合成RNA的过程。


常见问题:

问:PromoterDNA序列中是算内含子还是外显子?

答:都不是。属于noncoding sequence

问:UTRDNA序列中是算内含子还是外显子?

答:外显子。

问:起始密码子ATGgene的哪个位置?

答:外显子内,CDSATG开始。

问:每个基因之间都有一定的间隔序列,这些基因间的间隔序列应该不属于内含子吧?

答:是的。属于noncoding sequence

问:如何寻找启动子区域和预测转录因子结合位点?

答:见帖子http://www.dxy.cn/bbs/topic/23466429


彻底搞清楚promoter, exon, intron, and UTR (有图有真相).ppt







https://wap.sciencenet.cn/blog-1271266-792469.html

上一篇:奥黛丽·赫本名言精选
下一篇:bed format bed格式

1 苏光松

该博文允许注册用户评论 请点击登录 评论 (2 个评论)

数据加载中...

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2021-12-6 20:36

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部