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R语言与计算药物分析

已有 2038 次阅读 2016-6-27 21:47 |系统分类:科研笔记

前段时间,阅读了胡育筑老师主编的《计算药物分析》,书中列出了计算药物分析中列出的计算软件:excel和matlab。这两个软件均是很好的工具。但是,现在可以加入一个新的工具:R。
R语言在计算药物分析的工具:
1.数据输入输出系统(I/O)
R中有很多方便的输入和输出数据的函数:
1)excel和csv
2)数据库
3)netcdf:这个东西多说两句,关键是很多检测数据的可交换平台是netcdf格式,R中的函数提供了完美的支持。
2.应用方面
1)数据统计分析:这是R的强项和本行。
2)计算方法:相比matlab要弱,也已经够用。
3)模式识别:有成型的包可以使用。
4)动力学数据处理:也有合适的包,主要包括稳定性数据分析和药动数据分析。
5)bioassay:R中的包很强悍,自己去看一下。
个人觉得,R的包丰富,可以拿来就用,无疑是计算药物分析的利器。但是,不建议,刚开始就学,你会对R的语法晕菜的。        

但是,R语言的学习曲线比较高,对于做药物分析的人来说,会有点望而生畏。你可以尝试一下RCommander,在R中安装这个包后,你就可以像使用SAS一样使用R了。
RCommander的安装:
方法:在RGUI中的程序包菜单下点击安装程序包,设定好镜像后会出现各种包,点击Rcmdr后等待安装就可以了。
RCommander的使用:
参考John Fox教授的网友http://socserv.mcmaster.ca/jfox/Misc/Rcmdr/

在数据分析中的高等应用中,我们还是经常需要用到自己写函数,就需要一个良好的R编程程序,这时候Rstudio就是最好的R编程环境。                                                                                                                                                                                          



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