科学网

 找回密码
  注册
搜索
热搜: 科学 论文
搜索
置顶 · 学习生物信息的第二好教程
2017-7-7 08:15
生信的作用越来越大,想学的人越来越多,不管是为了以后发展,还是为了解决眼下的问题。但生信学习不是一朝一夕就可以完成的事情,也许你可以很短时间学会一个交互式软件的操作,却不能看完程序教学视频后就直接写程序。也许你可以跟着一个测序分析流程完成操作,但不懂得背后的原理,不知道什么参数需要修改,结果可以出 ...
个人分类: 生物信息|5188 次阅读|没有评论
赠你一只金色的眼 - 富集分析和表达数据可视化
陈同 2019-8-1 14:36
GOplot包介绍 GOplot包用于生物数据的可视化。更确切地说,该包将表达数据与功能分析的结果整合并进行可视化。但是要注意 该包不能用于执行这些分析,只能把分析结果进行可视化 。在所有科学领域,由于空间限制和结果所需的简洁性,切实地去描述事物很难,所以需要将信息进行可视化,使用图片来传达信息。精心设计的图形 ...
个人分类: 生物信息|3828 次阅读|没有评论
单基因GSEA怎么做?
陈同 2019-8-1 11:14
今天在讨论群看到有群友提问 单基因GSEA怎么做? 。之前也看到过这个概念,但一直不清楚这个 单 是什么含义,一直以为是用 单个基因做GSEA 。如果之前看过生信宝典的 一文掌握GSEA,超详细教程 ,一定会特别熟悉 GSEA 的原理和操作流程。当然越是理解,越是想不明白 单 个基因怎么做 GSEA 。当然如果您不熟悉GSEA, ...
个人分类: 生物信息|4707 次阅读|没有评论
挖掘PubMed数据库,获取报道的或推测新的基因调控关系
陈同 2019-5-12 14:18
生信宝典之傻瓜式推出过基于Cytoscape的插件 literature search 进行 文献挖掘查找指定基因调控网络的方 。 近来发现一款神奇的在线工具 (Chilibot, ch ip li terature ro bot ,http://chilibot.net/)可以完成同样的分析,而且看上去功能还更强大。 结果展示 采用两个关键词 cocaine 和 plasticity & ...
个人分类: 生物信息|1673 次阅读|没有评论
Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(九)- Scater包单细胞过滤
陈同 2019-4-22 18:30
往期系列 Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(一) Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(二) Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(三) Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(四) Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(五) Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(六) Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(七 ...
个人分类: 生物信息|2471 次阅读|没有评论
Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(七)-导入10X和SmartSeq2数据Tabula Muris
陈同 2019-4-22 18:15
往期系列 Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(一) Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(二) Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(三) Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(四) Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(五) Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(六) 收藏|北大生信平台单细胞分析、染色 ...
个人分类: 生物信息|3261 次阅读|没有评论
Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(六)
陈同 2019-4-22 17:23
Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(一) Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(二) Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(三) Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(四) Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(五) 收藏|北大生信平台单细胞分析、染色质分析视频和PPT分享 该如何自学入门生物信息学 ...
个人分类: 生物信息|5155 次阅读|没有评论
Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(五)
陈同 2019-4-22 17:21
Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(一) Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(二) Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(三) Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(四) 收藏|北大生信平台单细胞分析、染色质分析视频和PPT分享 该如何自学入门生物信息学 生物信息之程序学习 使用STAR比对read ...
个人分类: 生物信息|2300 次阅读|没有评论
Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(四)
陈同 2019-4-22 17:18
Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(一) Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(二) Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(三) 收藏|北大生信平台单细胞分析、染色质分析视频和PPT分享 生信老司机以中心法则为主线讲解组学技术的应用和生信分析心得 - 限时免费 测序文库拆分 (Demultiplexing) 文库拆 ...
个人分类: 生物信息|1460 次阅读|没有评论
Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(二)
陈同 2019-4-22 17:10
单细胞测序实验方法 开发scRNA-seq的新实验方法和操作手册是目前很火的研究领域,而且最近这些年已经发表了一些改进方法。上图可以看出检测的细胞数目以指数形式增加,以下是一份不完全的列表: STRT-seq Smart-seq CEL-seq MARS-seq SCRB-seq Smart-seq2 Drop-seq ...
个人分类: 生物信息|1727 次阅读|没有评论

本页有 1 篇博文因作者的隐私设置或未通过审核而隐藏

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2022-1-20 18:39

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部