chen7qi的个人博客分享 http://blog.sciencenet.cn/u/chen7qi

博文

Cell | 小鼠内皮细胞单细胞转录组图谱(详解)

已有 7576 次阅读 2020-5-24 22:08 |个人分类:生物信息|系统分类:科研笔记

2020年2月13日,比利时Leuven癌症研究所Peter Carmeliet、中山大学李旭日和丹麦Aarhus大学的Yonglun Luo合作于Cell发表了题为Single-Cell Transcriptome Atlas of Murine Endothelial Cells的文章,研究团队利用单细胞转录组技术分析了小鼠11个组织的内皮细胞,收集得到超过32000个单细胞转录组数据集,鉴定出78个内皮细胞亚群,揭示了不同组织中内皮细胞的相似性和异质性。

Summary:The heterogeneity of endothelial cells (ECs) across tissues remains incompletely inventoried. We constructed an atlas of >32,000 single-EC transcriptomes from 11 mouse tissues and identified 78 EC subclusters, including Aqp7+ intestinal capillaries and angiogenic ECs in healthy tissues. ECs from brain/testis, liver/spleen, small intestine/colon, and skeletal muscle/heart pairwise expressed partially overlapping marker genes. Arterial, venous, and lymphatic ECs shared more markers in more tissues than did heterogeneous capillary ECs. ECs from different vascular beds (arteries, capillaries, veins, lymphatics) exhibited transcriptome similarity across tissues, but the tissue (rather than the vessel) type contributed to the EC heterogeneity. Metabolic transcriptome analysis revealed a similar tissue-grouping phenomenon of ECs and heterogeneous metabolic gene signatures in ECs between tissues and between vascular beds within a single tissue in a tissue-type-dependent pattern. The EC atlas taxonomy enabled identification of EC subclusters in public scRNA-seq datasets and provides a powerful discovery tool and resource value.


研究背景

内皮细胞endothelial cell,EC)遍布血管,是氧气和营养物质输送、免疫细胞运输以及清除远组织废物的重要管道。血管系统由具有明显血管床(动脉、毛细血管、静脉)的血管组成,这些血管床对进出血液至关重要,对涉及渗出液排出的淋巴管也同样很重要。

不同组织中的EC具有异质性,可以满足每种组织的独特生理需求。例如,血脑和血视网膜屏障由紧密连接的EC组成,可以限制细胞旁扩散,而肝脏EC中的可渗透开口促进了溶质的交换。虽然bulk RNA测序(RNA-seq)揭示了组织之间的EC异质性,然而,单个组织内的ECs在单细胞水平上是否以及在何种程度上表型不同仍然未知,例如不同组织中特定血管床的ECs之间是否存在异质性。

最近,多个小鼠组织的单细胞图谱研究描述了EC却并没有将EC异质性作为主要目标。多个组织的单细胞EC转录组图谱可以增进对组织之间和组织内部EC多样性的了解。因此,作者从11个成年小鼠组织中的EC进行了scRNA测序。作者也提供了可视化网站https://www.vibcancer.be/software-tools/ec-atlas用以探索本文中的数据集。

研究方案

Sample:作者分别对8周龄C57BL6/J小鼠的11个组织中的内皮细胞进行分选分析,包括比目鱼肌、趾长伸肌(EDL)、心脏、小肠、结肠、肾脏、肺脏、脾脏、肝脏、睾丸和脑。

作者首先通过FACS流式分选,分选步骤大致相同,基本是根据CD45-CD31+富集内皮细胞,但不是每个器官都是相同的,比如肝脏使用CD11b–CD31+(评:其实大多数文章进行富筛的时候都是这样进行FACS分选,想想作者此时为什么对组织内皮细胞的富集方法略有区别)

测序数据分析介绍


  1. 工具: Chromium Single Cell 3′ Reagent Kits v2 ,CellRanger (10x Genomics, version 2.1.1) .

  2. 比对: mouse genome (build mm10) .

  3. 筛选:(i) genes expressed by less than 10 cells or with a row average of < 0.002 were not considered; (ii) cells that expressed fewer than 300 genes (low quality), and cells that expressed over 4,000 genes (potential doublets) were excluded from further analysis; (iii) cells in which over 10% of unique molecular identifiers (UMIs) were derived from the mitochondrial genome were removed.

  4. 降维,聚类:Seurat FindVariableGenes function (mean lower threshold = 0.0125, mean higher threshold = 8, dispersion threshold = 0.5 ),top 8 principal components (PCs) .

  5. GSVA: 利用MSigDB数据库中的血管有关数据集识别不同组织中富集的通路和细胞进程.

  6. SCENIC: SCENIC R package (version 1.1.0),进行转录因子网络的推断.

  7. 伪时序分析:SCORPIUS


结果分析

内皮细胞图谱的构建

作者对39,182个细胞进行了测序,平均每个细胞的测序深度为86,766 reads,测序饱和率为93%,每个细胞1,308个基因。经过滤和排除污染后,共发现32,567个EC,可以看出不同组织的EC表现出明显的转录组异质性(图1B)。

淋巴内皮细胞(Lymphatic ECs,LEC)在功能和解剖上与血管内皮细胞(称为“BEC”或“EC”)不同。利用排名前10位的marker基因表达热图分析显示,除了比目鱼肌(soleus)和趾长伸肌(EDL)骨骼肌表达重叠的标记基因外,每种组织都有不同的基因表达(图1C)。值得注意的是,部分marker基因仅在单个组织的EC表达(比如分别位于脑、睾丸和肺中的Pglyrp1,Lcn2和Tmem100),而其他EC marker(Fabp4,Aqp7,Nkx2-3)则表达在两个或多个组织中,EC量大的组织中也表达了大部分marker(图1D)。(评:其实同种细胞在不同器官中表达不同是非常正常的,部分基因也是为了适应该器官而存在,当然也包括驻留细胞maker,在肿瘤细胞中的特异性其实也是蛮明显的,并且不同个体相同肿瘤细胞在聚类时也往往会分开)


图1

(A) Scheme of study design.(B) t-SNE plot of in silico-selected ECs, color coded for tissue type.(C) Gene-expression heatmap of the top 10 marker genes for each tissue. Color scale: red, high expression; blue, low expression.(D) Violin plots of the expression of markers, highly expressed in a substantial fraction (49% to 100%) of ECs in the indicated tissues (% indicated on the right; in case of marker gene enrichment in multiple tissues, the violin plot with the highest expression is indicated by an asterisk)


血管内皮细胞的组织间异质性

为了研究跨组织的EC异质性,作者首先使用层次聚类发现有些组织的EC可以聚在一起,如睾丸和脑;肝和脾;小肠和结肠;骨骼肌比目鱼肌和EDL。

为了解释这种EC的组织分组现象,作者使用Molecular Signatures Database(MSigDB)内部生成一个有615个与血管相关的基因集的表并进行了基因集变异分析(GSVA)。对排名前10位的表达基因集的热图分析(图2B)显示,这些组织的ECs高表达的基因集参与了不同的生物学过程。大脑和睾丸ECs的高表达基因集了涉及跨膜运输,这与存在血液组织屏障相一致;肝和脾ECs的高表达基因集参与清除和免疫调节;结肠和小肠ECs的高表达的基因集参与了血管基底膜/胶原蛋白的沉积、VEGF信号传导和EC迁移,与其已知的维持肠道血管屏障作用一致;心脏EC的转录组与骨骼肌EC的相似,其中心脏的基因组富集在膜转运和氧化还原稳态通路,这与心脏的高度氧化微环境相一致,肺ECs则显示出丰富的免疫调节相关特征,表示在免疫监视中可能起作用;肾脏ECs的表达基因集与干扰素激活信号通路有关。有趣的是,这些组织的大多数EC均表现出独特的代谢基因特征。(评:代谢基因特征的不同其实也代表其生理功能的差异性,比较作为整个器官的一部分在发挥作用,而在相同肿瘤中会发现正常细胞如T,B的代谢较为相似,而在肿瘤细胞中的差异性较大。


图2

(A) Correlation heatmap and hierarchical clustering of EC gene-expression signatures of all tissues. Color differences in the dendrogram indicate clusters that were resolved by multiscale bootstrapping.(B) Heatmap showing processes enriched in different tissues. Gene-set signatures involved in similar processes were given a common name, followed by a number (between brackets) according to their order of appearance in the heatmap. Color coding from t-SNE in 图1B is shown above the heatmap.(C) Heatmap of the inferred transcription-factor gene-regulatory networks (SCENIC). Numbers between brackets indicate the (extended) regulons for respective transcription factors.(D) Gene-expression heatmap of transcription factors in (C). Color scale: red, high expression; blue, low expression.


转录因子网络分析

为了研究驱动EC表型不同的潜在分子机制,作者使用了单细胞调节网络推断和聚类(SCENIC)。该分析预测了不同组织的ECs上调不同转录因子网络的表达。例如,Foxq1Hoxd9调节子分别在大脑和睾丸的EC中上调,Foxf1网络在肺EC中富集,骨骼肌EC显示出Pparg网络的活动增加(图2C)。Gata家族成员的转录因子驱动的调节子富集在肝脏和脾脏的EC,Gata4网络在肝EC中上调,而在脾脏EC中主要检测到Gata6调节子(图2C)。脾脏也由Nr5a1Nfic驱动的网络上调(图2C)。(评:转录因子(Transcription factor,TF)是指能够结合在某基因上游特异核苷酸序列上的蛋白质,这些蛋白质能调控其基因的转录。在单细胞发育方面都会观察转录因子在基因调节中的作用。

组织内血管床的异质性

作者针对每种组织的内皮细胞进行基于图形的亚聚类,并通过统计其亚簇比例来研究组织内ECs的异质性。总共在所有组织中鉴得了78个不同的EC种群(图3;图S5A),包括:

(1)传统EC表型(动脉、毛细血管、静脉、淋巴管ECs),在不同组织中检测到的数量不同;(2)组织受限的EC人群(脑脉络丛;肠道中的Madcam1+ 静脉和Aqp7+毛细血管);(3)意料之外的EC表型,如脑、脾、肌肉和心脏中干扰素激活的EC;心脏、肌肉、睾丸和肾脏的血管生成性血管内皮细胞(angiogenic ECs);以及肝脏和脾脏中的增殖ECs。


图3


血管床的EC细胞比例在各个组织中都是占比最大(图4A)。为了鉴别EC的异质性,研究团队首先通过血管床中在组织间保存或以组织特异性方式表达的marker,将每个组织的所有簇分成4中EC表型(图4B):

(1)动脉ECs(包含大动脉和动脉EC子簇);(2)毛细血管ECs(所有毛细血管EC子簇);(3)静脉ECs(大静脉和静脉EC子簇);(4)淋巴ECs(所有淋巴EC子簇)。

作者检测到动脉、静脉和淋巴管中有多种保留的marker(conserved marker),毛细血管的保留marker较少,这突出了组织间毛细血管EC marker的更大异质性(图4C和4D)。并且在分析组织特异性血管床marker时候,毛细血管的组织特异性marker比淋巴中更多(图4C和4D)。这就提出了一个问题,即毛细血管ECs是否有更灵活地适应组织微环境,以满足组织的特定需要,而不是像淋巴管那样普遍地排除渗出液,而不管它们的组织微环境。

其次,为了探讨不同组织的同种血管床(动脉、毛细血管、静脉、淋巴管)的ECs在转录组上是否相似,作者对前50位marker基因集使用Jaccard相似性分析(图4e),分析表明,动脉ECs的转录组特征在各组织间比较相似,与血管床其他部分ECs的转录组特征不同。类似的发现也出现在毛细血管、静脉和淋巴管的ECs中(图4E)。这一分析并没有解决组织特异性EC异质性是否由起源组织或血管类型决定的问题。因此,作者对所有EC子簇进行了跨组织的层次聚类。从树状图中可以明显看出,EC子簇是按组织分组的,而不是按血管类型,表明组织类型(而不是血管类型)导致了EC的异质性(图S5E)。

最后,作者利用公开的Muris Tabula数据集,评估非内皮细胞中保留的和组织特异性EC标记基因的表达模式,发现每个组织都可以检测到在ECs中表达水平高于其他细胞类型的基因(>0.5 log2倍变化)。


图4

(A) Relative fraction of EC subclusters in different tissues. The relative contribution of each population was weighed by the number of cells per tissue and scaled to 100%.(B) t-SNE plots, color coded for EC subclusters from traditional vascular beds, across tissues.(C) Scheme of conserved and tissue-specific marker identification.(D) Dot plots of conserved and tissue-specific markers in ECs from the distinct vascular beds in different tissues. Red boxes, conserved markers between ECs from different tissues; blue boxes, tissue-specific markers; green box, capillary markers conserved across >65% of tissues. Dots: individual marker genes.(E) Three-dimensional PCA visualization of pairwise Jaccard similarity coefficients between ECs from distinct vascular beds in different tissues.


组织内分析揭示特定EC表型

然后,作者将重点放在具有特殊生物学特性的ECs上,这些ECs只在组织的一个子簇和这些组织的一小部分中被检测到。根据标记基因表达,除了一个静脉EC表型外,所有的特化EC表型都表达了毛细管标记,进一步说明了毛细管ECs的可塑性。

肠道中发现一小部分(5.6%-23.2%)毛细血管内皮细胞的转录水平升高,这些基因参与了甘油和脂肪酸(Aqp7、Tcf15、Cd36、Fabp5)的摄取和代谢(图3和图5a)。虽然从表面上看,ECs类似于乳管ECs(专门将膳食脂肪从肠道运输到血液的淋巴管),但这些ECs并不表达传统的淋巴marker(Prox1,Pdpn)(图5A),因此将该亚簇称为Aqp7+毛细管ECs(图3中的C5和SI4亚簇;图S5A)。

其他组织(心脏、骨骼肌)中的毛细血管内皮细胞普遍表达AQP7,但AQP7在肠毛细血管内皮细胞中的表达尚未见报道,可能是因为它只在这些细胞的一小部分中表达。尽管如此,Aqp7+毛细血管内皮细胞可能具有特殊的生理作用。此外,如图5A所示,作者鉴定了一小部分(4.7%-5.0%)肠静脉内皮细胞marker(EC marker Bgn)的表达,其具有丰富的高内皮微静脉marker(Madcam1、Lrg1、 Ackr1)的表达(图3中的C6和SI5;图S5A),代表一种特殊的ECs亚型,适用于从血液中招募/运输淋巴细胞到组织间质。

大脑中,作者发现了一小簇(1.4%)脉络丛毛细血管ECs(图3和S5A中的B9),其特征是已知标记基因plvap表达升高(图5b),这和先前描述有孔毛细血管参与脑脊液产生的报道一致。除了其他标记物(Plpp1、Plpp3、Cd24a、Nrp1),我们还检测到了Esm1的丰富表达(图5B),这是一种已知的脉络丛毛细血管ECs mRNA水平的标记物,但尚未在蛋白水平上进行验证。

作者还在健康器官的静息态内皮中检测到没有预料到的ECs。例如,在大脑、心脏、肌肉和脾脏中鉴得大量毛细血管ECs(1.7%-11.6%)表现出干扰素应答,因此被称为“干扰素激活的ECs”(B8、EDL5、H6、So6和Sp6,见图3;图S5A)。当聚焦于这5个组织中每个组织表达的前50个标记基因时,常常会检测到8个常见的干扰素诱导基因的子簇,因此可能有个疑问,即在这些组织中干扰素信号是否可能在健康的EC稳态中发挥作用(图5C)。

同样出乎人意料的是,作者在心脏、骨骼肌、肾脏和睾丸ECs(K7、H7、EDL6、So7和T6)中发现有大量血管生成基因表达特征的毛细管ECs(2.1% - 11.1%)(见图3;图S5A)。对其前50个marker基因的分析显示,在4/5的血管生成ECs组织中,7个基因的子集普遍上调(图5D,蓝色条形图),有报道说明其中部分为肿瘤血管中的细胞富集marker基因(Apln、Col4a2、Trp53i11)。值得注意的是,这些不同组织中的血管生成ECs并不总是表达相同的marker,这进一步说明了EC的异质性。

此外,在肝脏和脾脏中,增殖的毛细血管内皮细胞,表达典型的增殖marker(细胞周期蛋白依赖性激酶、高迁移率组蛋白等),分别为1.4%0.6%(图3中的Li6和Sp7;图S5A)。这两种EC表型共表达22个基因(图5E)。

研究团队还对EC marker(CD105或CD31)和这些特殊EC表型marker的双重免疫染色验证了scRNA-seq数据。


图5

(A and B) Dot-plot heatmap of markers enriched in intestinal Aqp7+ capillary and Madcam1+ vein ECs (A) and brain Plvap+ /Esm1+ choroid plexus capillary ECs (B); these EC subclusters were named after their most specifically expressed marker(s) (respectively Aqp7, Madcam, and Plvap/Esm1). The color intensity of each dot represents the average level of marker expression, whereas the dot size reflects the percentage of ECs expressing the marker within the EC subcluster.(C and D) UpSet plot of intersections between the top 50 markers expressed by interferon-activated (C) and angiogenic (D) ECs from the indicated tissues. Blue bar: intersecting genes (listed in blue), commonly detected in all or the majority of the tissues containing respectively the interferon-activated or angiogenic ECs. Black connected dots beneath the graph indicate which tissue clusters are intersected (highly expressing these markers).(E) Venn diagram showing genes upregulated in proliferating ECs. The number of congruently upregulated genes is indicated in the middle, their gene symbols are listed at the bottom.(F–I) Representative micrographs of mouse tissue sections, stained for an EC marker (CD105 in F and H; CD31 in G and I) and AQP7 (small intestine, F), ESM1 (choroid plexus, G), ISG15 (heart, H), and MKI67 (liver, I) and counterstained with Hoechst. Lower panels represent magnifications of the respective boxed areas in the upper panels. Scale bars, 10 mm (F); 250 mm (G); 25 mm (H and I).


利用伪时间分析预测这些EC亚群的分化轨迹

该伪时间分析预测了从动脉、毛细血管到静脉的轨迹(图S5B)。在作者使用marker对动脉,静脉和毛细血管进行标记后,在伪时间轨迹的动脉末端检测到了已知的脑动脉EC标记基因(Gkn3,Hey1),而已知的脑静脉标记基因Slc38a5在轨迹的静脉末端富集(图S5D)。在伪时间轨迹的中部,毛细血管标记基因Mfsd2a富集最多,而毛细血管-动脉标记基因Tgfb2和毛细血管-静脉标记基因Tfrc则位于伪时序轨迹的中间。该分析还显示,Fbln5Cytl1是大脑中的大动脉marker,Glu1是毛细血管-动脉marker,Rgcc是毛细血管marker,Car4是毛细血管-静脉marker,Lcn2是大静脉marker(图S5D)。因此,使用单细胞转录组进行谱系追踪可在不同的血管床中捕获各种EC亚型的解剖形貌(NBT|45种单细胞轨迹推断方法比较,110个实际数据集和229个合成数据集)。


图S5

(A) UMAP visualization of tissue-specific in silico selected ECs. Cells are color-coded for the 78 identified EC subclusters characterized by distinct gene expression signatures. Each subcluster was numbered and labeled with the first letter(s) of the tissue name (f.i. H1 for cluster 1 in the heart UMAP).(B) Pseudotime trajectory of the indicated brain EC phenotypes.(C,D) Loess regression-smoothened gene expression of the indicated large vessel marker genes at opposite ends of the pseudotime trajectory (C) and gene expression of the indicated marker genes enriched in the different EC phenotypes along the artery-capillary-vein axis in pseudotime (D). Regression span = 0.15 (local linear regression). For visualization purposes, the clusters detected in pseudotime were smoothened using quantiles (0.25 and 0.75 for lower and upper quantiles, respectively). Clusters are ordered based on their lower quantile value; new cluster value ranges are defined by averaging together the upper quantile of the first cluster and the lower quantile of the second cluster. The newly defined cluster ranges are used for plotting.(E) Dendrogram visualizing hierarchical clustering analysis of all EC subclusters from all tissues. Colors (red = heart large vein; green = colon capillary Aqp7+) indicate EC subclusters that did not group together with the other subclusters of their respective tissues of origin.


组织间代谢基因的异质性。

EC中所有可检测到的代谢基因是1,180个,并用热图分析排名前10位的代谢基因转录本的表达水平。除了比目鱼肌和EDL外,我们观察到不同组织的EC中不同代谢基因的表达。我们可以观察到大脑的EC上调了参与葡萄糖、氨基酸和脂肪酸转运的转运蛋白的表达,脾脏ECs上调了参与胆固醇代谢的基因的表达,肺ECs上调了与cAMP代谢有关的基因的表达,这支持了肺内皮完整性取决于cAMP水平的观点。最后,心脏和肌肉EC中表达较高转录水平的基因参与脂质吸收和代谢(图6F和6G),这与肌肉EC摄取甘油三酸酯以提供肌肉功能所需的货物和能量的理念相一致。

之后作者评估了EC异质性的另一个层面,即同一组织内不同血管床的ECs是否上调了不同代谢标记基因的转录本,以及这是否以组织依赖的方式发生。作者通过举一些典型的例子来强调这种复杂的异质性。例如,在大脑中,转运蛋白(transporter)基因在动脉、毛细血管、静脉和干扰素激活的ECs中表达上调,而在脉络丛(choroid plexus)ECs中没有上调(图6H)。Alpl标记物在动脉ECs中主要表达上调,Glul在毛细血管ECs中转录水平也较高,另一种标记物(Car4)在静脉、毛细血管和干扰素激活的ECs中表达较高,而在动脉中表达较低(图6H)。肝脏中血管床(Vascular-bed)ECs与其他组织不同,该组织的每个血管床中,某一部分的显著marker表达上调了,该marker在血管床其他部分(动脉中Nt5c3,毛细血管中Aass,静脉中Ptgs1)的上调幅度却是微乎其微(图6I)。在中,静脉通过上调特定代谢标志物的表达来区别于其他血管床(图6J)。因此,ECs在单个组织的不同血管床中以组织依赖的模式显示代谢基因表达的异质性。


图6

(A) Hierarchical clustering analysis of metabolic genes for all tissues. Color differences in the dendrogram indicate clusters that were resolved by multiscale bootstrapping.(B) Heatmap showing the expression of the top 10 metabolic genes enriched in ECs from different tissues.(C–F) Tissue-specific EC expression heatmaps of representative metabolic genes involved in transport (C), cholesterol metabolism (D), cAMP metabolism/biosynthesis (E), and lipid metabolism (F).(G) t-SNE plots showing upregulated expression of representative metabolic genes (in red) for different tissues.(H–J) Violin plots showing the expression of representative metabolic marker genes for brain (H), liver (I), and lung (J) EC phenotypes, showing the distribution of expression levels of the selected metabolic marker genes in different vascular beds.


EC Atlas分类在其他数据集中识别EC表型的有效性

作者探索了EC Atlas分类在识别其他可公开获得的scRNA-seq数据集中的EC表型的有效性。作者使用了Tabula Muris的肝脏、心脏、大脑、肾脏、后肢肌肉和肺部数据集的EC。通过使用scmap和每种EC表型的前10个标记基因,几乎所有EC都可以匹配到EC Atlas分类中检测到的一种组织特异性EC表型(图7A),并且不同性别的EC没有差异。(scamp:一种将来自scRNA-seq数据集的细胞投射到其他实验细胞类型的方法,用于自动区分细胞类型。)


图7

(A) Sankey diagrams, showing the scmap cluster projection of the Tabula Muris ECs in different tissues to the EC Atlas taxonomy; Tabula Muris ECs are annotated according to mouse gender. Similarity scores of Tabula Muris ECs for each EC Atlas EC subcluster per tissue are shown in boxplots. Unassigned cells are indicated in gray. Soleus and EDL ECs from the EC Atlas were pooled and denoted “EC Atlas muscle.”(B)Dendrogram visualization of hierarchical clustering analysis of EC phenotypes assigned by scmap (using top 10 marker genes for each EC phenotype), derived from female (F) and male mice (M). Color differences in the dendrogram indicate subclusters, resolved by multiscale bootstrapping.(C–E) Sankey diagrams, showing the scmap cluster projections of brain ECs from Vanlandewijck et al. (2018) (C), lung ECs from He et al. (2018) (D), and cardiac ECs from Zhao et al. (2018) (E) to the EC Atlas taxonomy. Similarity scores for each EC Atlas EC subcluster per tissue are shown in boxplots.


文章解读:Tiger

文章校对:生信宝典

参考文献

Kalucka J, de Rooij LPMH, Goveia J, Rohlenova K, Dumas SJ, Meta E, Conchinha NV, Taverna F, Teuwen LA, Veys K, García-Caballero M, Khan S, Geldhof V, Sokol L,Chen R, Treps L, Borri M, de Zeeuw P, Dubois C, Karakach TK, Falkenberg KD, Parys M, Yin X, Vinckier S, Du Y, Fenton RA, Schoonjans L, Dewerchin M, Eelen G,Thienpont B, Lin L, Bolund L, Li X, Luo Y, Carmeliet P. Single-Cell Transcriptome Atlas of Murine Endothelial Cells. Cell. 2020 Feb 20;180(4):764-779.e20. doi:10.101

你可能还想看





https://wap.sciencenet.cn/blog-118204-1234755.html

上一篇:单细胞RNA-seq预处理工具比较分析(bioRxiv)
下一篇:Science | 单细胞分析人类胸腺发育的细胞图谱

1 鲁云霞

该博文允许注册用户评论 请点击登录 评论 (1 个评论)

数据加载中...

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2022-7-5 09:10

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部