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置顶 · 学习生物信息的第二好教程
2017-7-7 08:15
生信的作用越来越大,想学的人越来越多,不管是为了以后发展,还是为了解决眼下的问题。但生信学习不是一朝一夕就可以完成的事情,也许你可以很短时间学会一个交互式软件的操作,却不能看完程序教学视频后就直接写程序。也许你可以跟着一个测序分析流程完成操作,但不懂得背后的原理,不知道什么参数需要修改,结果可以出 ...
个人分类: 生物信息|5057 次阅读|没有评论
积微论坛第一期 - 基于大数据整合预测土壤枯萎病的发生 (文稿分享)
陈同 2020-11-2 21:37
生物信息学习的正确姿势 NGS系列文章包括 NGS基础 、 高颜值在线绘图和分析 、转录组分析( Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这 )、ChIP-seq分析( ChIP-seq基本分析流程 )、单细胞测序分析( 重磅综述:三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程 )、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数 ...
个人分类: 生物信息|1727 次阅读|没有评论
可视化之为什么要使用箱线图?
陈同 2020-11-2 21:37
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个人分类: 生物信息|3197 次阅读|没有评论
这个40M的小工具助你在windows下处理数据如虎添翼!!
陈同 2020-11-2 21:36
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个人分类: 生物信息|1516 次阅读|没有评论
GO、GSEA富集分析一网打进
陈同 2020-11-2 21:35
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个人分类: 生物信息|5243 次阅读|没有评论
Volcano plot | 别再问我这为什么是火山图 (在线轻松绘制)
陈同 2020-11-2 21:35
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WGCNA分析,简单全面的最新教程(可以在线做了)
陈同 2020-11-2 21:34
生信学习的正确姿势(第三版) NGS系列文章包括 NGS基础 、转录组分析( Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这 )、ChIP-seq分析( ChIP-seq基本分析流程 )、单细胞测序分析( 重磅综述:三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程 (原理、代码和评述) )、DNA甲基化分析、重测序分析、 ...
个人分类: 生物信息|3898 次阅读|没有评论
图形解读系列 | 散点图也不简单
陈同 2020-7-9 14:03
识图:先理解 每个点是什么 (点代表基因、样品、通路或其它的,这个认识可以来自于常识,来自于自己对数据的认识,或来自于文章作者的描述),然后看 横轴代表什么 、 纵轴代表什么 ,再看图例中展示的其他信息如颜色、大小和形状分别代表什么。这些都理顺了,图理解就不难了。 来源:https://www.r-graph-galle ...
个人分类: 生物信息|5798 次阅读|没有评论
哈佛大学单细胞课程:笔记汇总前篇
陈同 2020-7-9 13:59
单细胞转录组测序进展迅速,伴随而来的是许许多多的内容与讲义,很多课程都老长。。。嗨像我这样莫有耐心的小孩子,能完整看完的只有一个 —— Single-cell RNA-seq analysis workshop (https://github.com/hbctraining/scRNA-seq)。我将把教程内容尽量汇总,你需要做的就是点击收藏慢慢看! (一)Why single-cell RNA ...
个人分类: 生物信息|3269 次阅读|没有评论
NC文章详解 | 鼠成纤维细胞单细胞分析发现成纤维细胞在心肌细胞成熟中起关键作用
陈同 2020-7-9 13:56
Cardiac maturation lays the foundation for postnatal heart development and disease, yet little is known about the contributions of the microenvironment to cardiomyocyte maturation. By integrating single-cell RNA-sequencing data of mouse hearts at multiple postnatal stages, we construct cellul ...
个人分类: 生物信息|1946 次阅读|没有评论

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