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2019-5-30 16:01
本人从事林业统计分析,主编R与ASReml软件的教材2部,主译学术专著1部。熟悉植物遗传评估,擅长R软件与ASReml软件。熟悉R编程,包括常见的基础统计(方差分析、协方差分析、t检验等)和高级统计(主成分分析、聚类分析、判别分析等);同时,也善于使用R软件进行图形的绘制,包括高级程序包ggplot2和lattice;此外,本 ...
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[重磅推荐]免费版的动植物遗传评估软件Echidna
林元震 2019-12-25 13:36
关于Echidna软件 Echidna( https://www.echidnamms.org/ )由ASReml软件原开发者Arthur Gilmour开发,其功能接近于ASReml,但对于非商业使用者是免费的。 注意:国内网无法直接注册和下载。 Echidna Mixed Models Software. Developed free for non-commercial use. Echidna performs statistic ...
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用ASReml运行多点试验多性状的因子模型
林元震 2019-10-7 09:32
版权声明:本文为博主原创文章,遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议,转载请附上原文出处链接和本声明。 本文链接:https://blog.csdn.net/yzhlinscau/article/details/102239222 &n ...
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《动植物育种遗传数据分析》网购途径--更新
林元震 2019-9-27 21:52
《动植物育种遗传数据分析》由科学出版社发行,2019年9月1日上市。目前,京东、当当网已全面上线。如需本人签名售书的(仅剩几本),请发邮件至yzhlinscau@163.com。 因受博客24小时后不能更新,签名售书的以实际情况为准,售完即止,博文不再做额外声明。 凡是通过正规途径购买或获得《动植物育种遗传数据 ...
个人分类: ASReml|2400 次阅读|没有评论
《动植物育种遗传数据分析》全书数据和代码的获取方式
林元震 2019-9-24 09:42
凡是通过正规途径购买或获得《动植物育种遗传数据分析》的读者,均可发邮件至yzhlinscau@163.com索取全书数据和代码,邮件里请注明姓名,并请截图购买途径或截图本人签名页。同时,请不要将全书数据和代码上传网络,否则后果自负。谢谢! 林元震
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ggplot--python版的ggplot2
林元震 2019-9-18 11:01
坦白来说,已习惯了R语言ggplot2包的绘图方式,用python来画图,真得非常不习惯。通过搜索,发现ggplot包, 非常类似R里的ggplot2。 这是ggplot的官网(http://ggplot.yhathq.com/),有点遗憾的是好像2016年后就没更新了。 具体示例代码请见链接: https://blog.csdn.net/yzhlinscau/article/details/100975562 ...
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通过python运行asreml-R程序
林元震 2019-9-17 21:09
ASReml是遗传评估的先锋软件,但其R版本在R语言中的运行,受R语言的影响,有时速度上确实会有些慢。Python在数据量比较大时,运行速度确实快过R语言。所以,我也想试试,能否在Python中运行asreml-R程序。答案是可行。不过,R与Python两种语言,在语法和编程上有所区别,仍需继续摸索。 具体示例请见链接: https://blo ...
个人分类: ASReml|2091 次阅读|没有评论
从一篇英文文章审稿想起的
热度 5 林元震 2019-9-16 11:53
前些天,planta期刊让我审阅一篇英文文章。一开始我以为是垃圾邮件,后来该期刊编辑再次来信提醒,我方才知道是真的。为何我最初认为是假的,我自己从未在该期刊发表过文章,事实上,目前我课题组的实验结果和论文水平还未达到该期刊的水平。 这篇论文是兰州大学某课题组的,我不认识。他们的论文也是做G6PD酶家族 ...
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如何对一个或多个asreml模型结果进行批量pin计算
林元震 2019-9-3 16:54
本文链接:https://blog.csdn.net/yzhlinscau/article/details/100519053 1 pin.batch 用于单个asreml模型结果的批量pin计算,用法如下: ##S3methodforclass'asreml' ...
个人分类: ASReml|2103 次阅读|没有评论
《动植物育种遗传数据分析》签名预售书
林元震 2019-8-30 18:14
由美国北卡州立大学Isik教授等人主编的《Genetic data analysis for plant and animal breeding》是关于动植物遗传评估的最新权威著作,该书很好得衔接了如何将数量遗传学以及遗传评估软件与实践教学科研及生产紧密结合。 该书中文版将于2019年9月由科学出版社正式出版。 该中文版定价:168元。出版社给我的书数 ...
个人分类: ASReml|2425 次阅读|没有评论
ASReml-R如何拟合空间效应与竞争效应的林木遗传分析模型
林元震 2019-8-24 17:42
2017年我们在《华南农业大学学报》上发表了名为《基于空间效应与竞争效应的林木遗传分析模型》(http://xuebao.scau.edu.cn/zr/hnny_zr/ch/reader/view_abstract.aspx?file_no=20170513flag=1)的论文。该文中提出了一种新的个体(或动物)模型,该模型涵盖了空间残差效应和遗传竞争效应。我们知道,如果一棵树周围都存在 ...
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