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置顶 · 提供数据分析服务-本帖长期有效(5月更新)
2019-5-30 16:01
本人从事林业统计分析,主编R与ASReml软件的教材2部,主译学术专著1部。熟悉植物遗传评估,擅长R软件与ASReml软件。熟悉R编程,包括常见的基础统计(方差分析、协方差分析、t检验等)和高级统计(主成分分析、聚类分析、判别分析等);同时,也善于使用R软件进行图形的绘制,包括高级程序包ggplot2和lattice;此外,本 ...
个人分类: R|3370 次阅读|没有评论
基于空间效应与竞争效应的单株混合模型
2017-6-2 14:00
个人分类: ASReml|2283 次阅读|没有评论
《R与ASReml-R统计学》已上市--购买途径
热度 1 2017-4-25 09:14
本书分11章,具体为R简介、基础语法、数据创建、数据管理、基础统计、高级统计、试验设计、基础绘图、高级绘图、遗传评估和程序包开发。全书大概600页,定价68元。本书由美国北卡州立大学知名数量遗传学家Fikret Isik教授作序。 购买方式: 京东、淘宝、天猫。其他网站目前无法购买。 林元震 ...
个人分类: R|3089 次阅读|1 个评论 热度 1
遗传分析R包推荐--breedR(一)
2017-3-8 16:48
breedR包由法国人facundo munoz开发的,源于对林业遗传分析所用,现已用于动植物遗传分析。其内核也是基于REML理论,所用的编程语言基于Fortran,可做类似于ARSReml-R包的分析,遗憾的是,目前该程序包暂时未能用于多性状分析和基因组选择分析。 下文做一简单的示范。 程序包的安装: if( !requir ...
个人分类: breedR|4770 次阅读|没有评论
《R与ASReml-R统计学》封面草稿
热度 1 2016-12-21 11:11
欢迎各位对于本书的封面,提建议。谢谢。
个人分类: ASReml|3314 次阅读|1 个评论 热度 1
新书《R与ASReml-R统计学》年底出版
热度 2 2016-10-21 15:54
前言 R 语言在国内日趋热门,这点从近些年国内 R 会议的参加人数变化即可看出, 2012 年约为 400 人, 2013 年约为 600 人, 2014 年约为 1400 人, 2015 年达到 4200 人,据统计 2016 年参会人员将突破 1 万人,俨然是国内规模最大的专题会议。 R 会议地点也从最早的北京,到上海、深圳、 ...
个人分类: ASReml|5246 次阅读|2 个评论 热度 2
AAfun的在线安装
2016-5-16 13:47
AAfun的最新版本为2.6,且现在可以在线安装了,电脑需要联网。目前,AAfun仅在windows系统下使用,其他系统可能不通用。安装方式如下: 安装的过程会需要下载一些依赖的程序包,等那些依赖的程序包安装完毕后,就会进行AAfun的安装。 欢迎各位网友使用AAfun包时,有任何问题均给我邮件(yzhlinscau@163.com)。
个人分类: ASReml|3134 次阅读|没有评论
AAfun V2.0包的功能列表
2015-12-2 23:17
AAfun包是本人针对ASReml-R和MCMCglmm包增加了几个函数,用于实现一些它们目前无法实现的一些功能,主要函数功能如下: 1. pin() 主要用于ASReml-R计算遗传力,遗传相关等参数值及其误差值 3. met.plot(),met.corr(),met.biplot() 主要用于ASReml-R对多地点试验分析时绘制原始数据,输出地点遗传相关矩阵以 ...
个人分类: ASReml|2834 次阅读|没有评论
AAfun2.0版本已完成
2015-11-5 13:32
AAfun包主要针对ASReml-R添加一些功能,有感兴趣者,请到网盘http://yzhlin-asreml.ys168.com/自行下载,也欢迎使用过程中,有任何问题,可以反馈给我(yzhlinscau@163.com)。
个人分类: ASReml|1966 次阅读|没有评论
random regression model之ASReml V4篇
2014-9-23 11:15
为何使用random regression( RR) model ?举个简单的例子,当测量的次数为 10 时,直接使用 US 矩阵需要初始值为 10*11/2=55 个,而用 pol(Age,2) 来拟合的话,所需初始值为 =(2+1)* (2+2)/2=6 个,大大降低了参数数量,也使得 ASReml 运行更容易收敛。 现举个简单的例子,某物种,目标性状为壳长 ...
个人分类: ASReml|3935 次阅读|1 个评论
ASReml-R与协变量模型分析
2014-8-7 14:20
实际工作中,常常会遇到不同年份的试验,数据如何整合一起分析。这里举个简单的例子,有一片种源试验林,其中2块为8年林,一块为9年林。把上述3片林一起分析,进而选择表现好的种源。这时,就可以将年份作为协变量,引入线性模型中,消除年份的影响,从而可以筛选出目标种源。 首先,数据的部分格式如下: ...
个人分类: ASReml|2827 次阅读|没有评论

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GMT+8, 2024-4-18 13:50

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