置顶 · 提供数据分析服务-本帖长期有效（5月更新）

2019-5-30 16:01

本人从事林业统计分析，主编R与ASReml软件的教材2部，主译学术专著1部。熟悉植物遗传评估，擅长R软件与ASReml软件。熟悉R编程，包括常见的基础统计（方差分析、协方差分析、t检验等）和高级统计（主成分分析、聚类分析、判别分析等）；同时，也善于使用R软件进行图形的绘制，包括高级程序包ggplot2和lattice；此外，本 ...

个人分类: R|3375 次阅读|没有评论

新书《R与ASReml-R统计学》年底出版

热度 2 林元震 2016-10-21 15:54

前言 R 语言在国内日趋热门，这点从近些年国内 R 会议的参加人数变化即可看出， 2012 年约为 400 人， 2013 年约为 600 人， 2014 年约为 1400 人， 2015 年达到 4200 人，据统计 2016 年参会人员将突破 1 万人，俨然是国内规模最大的专题会议。 R 会议地点也从最早的北京，到上海、深圳、 ...

个人分类: ASReml|5247 次阅读|2 个评论 热度 2

AAfun的在线安装

林元震 2016-5-16 13:47

AAfun的最新版本为2.6，且现在可以在线安装了，电脑需要联网。目前，AAfun仅在windows系统下使用，其他系统可能不通用。安装方式如下： 安装的过程会需要下载一些依赖的程序包，等那些依赖的程序包安装完毕后，就会进行AAfun的安装。 欢迎各位网友使用AAfun包时，有任何问题均给我邮件(yzhlinscau@163.com)。

个人分类: ASReml|3138 次阅读|没有评论

AAfun V2.0包的功能列表

林元震 2015-12-2 23:17

AAfun包是本人针对ASReml-R和MCMCglmm包增加了几个函数，用于实现一些它们目前无法实现的一些功能，主要函数功能如下： 1. pin() 主要用于ASReml-R计算遗传力，遗传相关等参数值及其误差值 3. met.plot()，met.corr()，met.biplot() 主要用于ASReml-R对多地点试验分析时绘制原始数据，输出地点遗传相关矩阵以 ...

个人分类: ASReml|2835 次阅读|没有评论

AAfun2.0版本已完成

林元震 2015-11-5 13:32

AAfun包主要针对ASReml-R添加一些功能，有感兴趣者，请到网盘http://yzhlin-asreml.ys168.com/自行下载，也欢迎使用过程中，有任何问题，可以反馈给我(yzhlinscau@163.com)。

个人分类: ASReml|1970 次阅读|没有评论

random regression model之ASReml V4篇

林元震 2014-9-23 11:15

为何使用random regression( RR) model ？举个简单的例子，当测量的次数为 10 时，直接使用 US 矩阵需要初始值为 10*11/2=55 个，而用 pol(Age,2) 来拟合的话，所需初始值为 =(2+1)* (2+2)/2=6 个，大大降低了参数数量，也使得 ASReml 运行更容易收敛。 现举个简单的例子，某物种，目标性状为壳长 ...

个人分类: ASReml|3941 次阅读|1 个评论

ASReml-R与协变量模型分析

林元震 2014-8-7 14:20

实际工作中，常常会遇到不同年份的试验，数据如何整合一起分析。这里举个简单的例子，有一片种源试验林，其中2块为8年林，一块为9年林。把上述3片林一起分析，进而选择表现好的种源。这时，就可以将年份作为协变量，引入线性模型中，消除年份的影响，从而可以筛选出目标种源。 首先，数据的部分格式如下： ...

个人分类: ASReml|2831 次阅读|没有评论

ASReml-R与阈性状(threshold trait)分析

林元震 2014-5-27 10:54

阈性状 (threshold trait )：性状数值达到某一特定值时表现为正常，达不到则为不正常，如血压，血糖含量、生物的抗病力等，在数据方面以0、1表示，属于二元数据分布。ASReml也可以轻松应付 阈性状，通过family参数选择 binomial函数来分析 。 举一个简单的例子： 1 2 ...

个人分类: ASReml|4944 次阅读|没有评论

【5.21更新】自编程序包AAfun的一些功能（之二）

林元震 2014-5-14 10:58

AAfun程序包，最近又做了更新，对应的例子脚本AAfun.R也更新了，请感兴趣的朋友到网盘 http://yzhlin-asreml.ys168.com/ 上下载。此博客今后只增加更新的记录，不再上传更新的程序包AAfun。 更新记录： 5.21更新：增加ir2r.sp()功能；spd.plot()增加了参数na。 5.19更新：增加mc.se()功 ...

个人分类: ASReml|3063 次阅读|没有评论

自编程序包AAfun的一些功能（之一）

林元震 2014-5-14 10:40

本人在ASReml-R程序包的使用中，编写了一个程序包AAfun，增加一些额外的函数，作为ASReml-R的辅助。主要功能如下： 功能一、asreml.pin，用于计算遗传力、遗传相关等参数，并得到遗传相关的显著性水平。 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 ...

个人分类: ASReml|3882 次阅读|没有评论

本页有 1 篇博文因作者的隐私设置或未通过审核而隐藏