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2019-5-30 16:01
本人从事林业统计分析,主编R与ASReml软件的教材2部,主译学术专著1部。熟悉植物遗传评估,擅长R软件与ASReml软件。熟悉R编程,包括常见的基础统计(方差分析、协方差分析、t检验等)和高级统计(主成分分析、聚类分析、判别分析等);同时,也善于使用R软件进行图形的绘制,包括高级程序包ggplot2和lattice;此外,本 ...
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ASReml-R与遗传评估的使用指南之2--多性状模型
林元震 2017-12-28 19:51
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ASReml-R与遗传评估的使用指南之基本用法1
林元震 2017-12-28 19:35
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AAfun升级至新版本AAfun4及其在ASReml-R V4的使用示范
林元震 2017-10-7 14:46
AAfun4新版本,可以同时适用于ASReml-R V3和V4,而且相比于之前版本,主要函数pin()和asreml.batch()的功能大大增强了。 asreml.batch(),除了可用于之前的那些常规模型,也可用于空间分析的单性状和多性状模型,而且还可用于非正态分布型性状。pin(),在V4中可像V3一样使用方便,比ASReml-R自带的vpredict()好用。 ...
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ASReml-R V4的新特性
林元震 2017-8-26 16:57
在ASReml-R V4的referrence manual第60页中,终于列出了千呼万唤的计算标准误函数vpredict(),据该函数介绍其可用于遗传力、遗传相关等指标的标准误计算。然我在运行自己的例子时,发现计算结果有误。 首先按手册运行其例子,发现运行结果也与手册的不同,不知是何故?应该是手册里的结果有误。 实际运行结 ...
个人分类: ASReml|4044 次阅读|1 个评论
<R与ASReml-R统计学>部分错误更正
林元震 2017-8-23 10:20
因部分内容直接保留了上一版,但新版中输出已经不同,导致部分代码和结果有误,例如pp144;第10章中pp499,遗传力计算公式有误,应分别为pin(hs.asr, h2.i~4*V2/(V2+V3+V4))和pin(hs2.asr,h2.it~V2/(V2+V3))。此外,书中仍可能存在部分差误,欢迎读者们告知我,以在将来的下一版更正。谢谢! 林元震
个人分类: ASReml|2469 次阅读|没有评论
基于空间效应与竞争效应的林木遗传分析模型--全文下载
林元震 2017-8-20 11:13
中文摘要 : 建立空间效应与竞争效应的分析模型,以提高林木遗传评估的准确性. 利用R软件及其程序包breedR模拟数据,结合实测数据,采用XFA1结构拟合加性效应、近邻竞争效应和AR1结构拟合空间效应,建立随机区组设计模型(RCBM)、空间模型(SM)、空间与测量误差模型(SUM)和空间与竞 ...
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动植物育种遗传数据分析(中文版)--第6章
林元震 2017-7-5 13:35
ch06-多性状模型 下载暂停! ch06-多性状模型.pdf
个人分类: ASReml|4276 次阅读|1 个评论
动植物育种遗传数据分析(中文版)--第1章
林元震 2017-6-22 14:54
北卡州立大学ISIK主编的《 Genetic Data Analysis for Plant and Animal Breeding 》应该是目前ASReml软件使用手册中最实用的也最新的,对于国内ASReml用户来说,这本书无疑是提升ASReml水平的很好参考书。ISIK教授在其官方网页也提供了该书草稿,因新书在出版中,目前草稿只能在8月份后才能下载。我很早就想过翻译这本书 ...
个人分类: ASReml|4601 次阅读|没有评论
基于空间效应与竞争效应的单株混合模型
林元震 2017-6-2 14:00
个人分类: ASReml|2451 次阅读|没有评论
《R与ASReml-R统计学》封面草稿
热度 1 林元震 2016-12-21 11:11
欢迎各位对于本书的封面,提建议。谢谢。
个人分类: ASReml|3499 次阅读|1 个评论 热度 1

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