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ASReml| R| breedR| python| 数量遗传学| Echidna|
置顶 · 提供数据分析服务-本帖长期有效（5月更新）
2019-5-30 16:01
本人从事林业统计分析，主编R与ASReml软件的教材2部，主译学术专著1部。熟悉植物遗传评估，擅长R软件与ASReml软件。熟悉R编程，包括常见的基础统计（方差分析、协方差分析、t检验等）和高级统计（主成分分析、聚类分析、判别分析等）；同时，也善于使用R软件进行图形的绘制，包括高级程序包ggplot2和lattice；此外，本 ...
个人分类: R|3385 次阅读|没有评论
AAfun4包的部分更新
林元震 2019-7-19 11:40
因科学网对程序代码支持差，具体博文请见下述网页： https://blog.csdn.net/yzhlinscau/article/details/96477198 注：最新的AAfun4包 不再免费提供。
个人分类: ASReml|1252 次阅读|没有评论
一步法GBLUP(SS-GBLUP)的实施
林元震 2019-7-1 21:04
一步法GBLUP(SS-GBLUP)可综合利用基因分型数据和谱系文件的全部信息，进行基因组BLUP，获得更多可靠结果。AAfun4包最新版里添加了函数AGH.inv()，用于计算H矩阵的逆矩阵，可用于SS-GBLUP。 简单示范如下： library(AAfun4) data(ugped)#未基因分型的谱系文件 data(gped)&nbs ...
个人分类: ASReml|4821 次阅读|没有评论
ASReml-R遗传评估第二期实训会正式通知（2019年6月20日-22日，广州）
林元震 2019-4-16 13:50
伴随着数量遗传学发展起来 的 SAS 、 DMU 、 BLUP90 和 ASReml 等遗传统计软件，在动植物育种上发挥了重要作用。其中， ASReml 是一个非常强大的统计软件，最早由澳洲 NSW Department of Primary Industries ( 澳洲新南威尔士州第一产业部 ) 的 Arthur Gilmour 博士开发。该软件专门用于海量数据的混合 ...
个人分类: ASReml|2554 次阅读|没有评论
ASReml-R 4.1软件包已在官网发布！
林元震 2018-12-20 19:58
ASReml-R 4.1软件包已在官网发布！目前软件包对所有人开放，可自由下载！ 官网下载地址： https://asreml.kb.vsni.co.uk/knowledge-base/asreml-r-4-download/ ASReml-R 4.1软件包与之前的版本，在使用上存在较大的差异，对于老用户，需要重新适应！ ASReml-R 4.1软件包采用最新的license授权系统，之前拥有A ...
个人分类: ASReml|5973 次阅读|没有评论
自交对植物遗传评估的影响
林元震 2018-8-22 15:08
作者：林元震 博文地址： https://yzhlinscau2018.netlify.com/programming/r/self/ 当亲本之一未知时，且物种可以自交，则需要在遗传评估中考虑自交的可能性。例如，对于桉树，假设自交概率为0.3是很普遍的。如果不考虑自交，则加性遗传方差将会被高估，因为子代并不都是半同胞 ...
个人分类: ASReml|1574 次阅读|没有评论
2015年在学院的吹水汇报^_^
林元震 2018-5-29 13:31
个人分类: ASReml|2542 次阅读|没有评论
ASReml-R与遗传评估的使用指南之5--因子分析模型
林元震 2017-12-28 20:58
个人分类: ASReml|2998 次阅读|没有评论
ASReml-R与遗传评估的使用指南之5--空间分析
热度 1 林元震 2017-12-28 20:39
个人分类: ASReml|2835 次阅读|1 个评论 热度 1
ASReml-R与遗传评估的使用指南之4--复杂模型
林元震 2017-12-28 20:27
个人分类: ASReml|2492 次阅读|没有评论
ASReml-R与遗传评估的使用指南之3--基本模型
林元震 2017-12-28 20:11
个人分类: ASReml|2660 次阅读|没有评论
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