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置顶 · 提供数据分析服务-本帖长期有效(5月更新)
2019-5-30 16:01
本人从事林业统计分析,主编R与ASReml软件的教材2部,主译学术专著1部。熟悉植物遗传评估,擅长R软件与ASReml软件。熟悉R编程,包括常见的基础统计(方差分析、协方差分析、t检验等)和高级统计(主成分分析、聚类分析、判别分析等);同时,也善于使用R软件进行图形的绘制,包括高级程序包ggplot2和lattice;此外,本 ...
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生态R包spatstat的部分用法(二)
热度 1 林元震 2019-1-7 11:02
继之前的帖子,该部分的代码,主要来自咨询我问题的朋友提供的。我帮忙查看运行代码,下述的代码相对会专业一点,可能更利于生态学的网友。 1. 数据读取 library(spatstat) setwd(C:/Users/yzhlin/Desktop/LS) df-readxl::read_excel(data1.xls,sheet=1,skip=1) df1-df 2. ...
个人分类: R|7618 次阅读|1 个评论 热度 1
生态R包spatstat的部分用法(一)
热度 2 林元震 2019-1-7 10:33
前段时间,有个朋友,问我如何用R解决生态学的部分问题,主要是空间生态学的问题。这对我来说,已经跨行了,后来咨询一位生态学钟博士,他给了一点代码,在此基础上,我做了一些分析。关于spatstat包的中文帖子好像没有,于是,写点用法,供有需要的网友参考。 1 数据读取 library(spatstat) setwd(C:/Users/y ...
个人分类: R|8647 次阅读|2 个评论 热度 2
《动植物育种遗传数据分析》中文版预计19年6月前发行
热度 1 林元震 2018-12-29 12:32
该书已全部翻译和校对完毕,并已交给科学出版社。按照计划,中文版应该在19年6月前正式发行。中文版邀请了中国工程院院士张守攻研究员、瑞典农业大学知名数量遗传学家Harry Wu教授作序。欢迎感兴趣的网友关注! 林元震 2018.12.29
2497 次阅读|2 个评论 热度 1
ASReml-R 4.1的在线激活
林元震 2018-12-27 18:51
今天终于收到VSNi发来的激活码,以为直接copy到Rstudio运行界面就可以激活,结果unsuccessful! 原因是ASReml-R 4.1需要特定的TCP端口,于是百度搜索如何设定,按该网页( https://zhidao.baidu.com/question/16935.html )提供的流程操作即可,端口值5053和0。 设置完端口,再进入Rstudio,运行下述代码进 ...
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ASReml-R 4.1软件包已在官网发布!
林元震 2018-12-20 19:58
ASReml-R 4.1软件包已在官网发布!目前软件包对所有人开放,可自由下载! 官网下载地址: https://asreml.kb.vsni.co.uk/knowledge-base/asreml-r-4-download/ ASReml-R 4.1软件包与之前的版本,在使用上存在较大的差异,对于老用户,需要重新适应! ASReml-R 4.1软件包采用最新的license授权系统,之前拥有A ...
个人分类: ASReml|5973 次阅读|没有评论
征集《动植物育种遗传数据分析》中文版出版费用的倡议书
林元震 2018-11-29 12:55
由美国北卡州立大学Isik教授等人主编的《Genetic data analysis for plant and animal breeding》是关于动植物遗传评估的最新权威著作,该书很好得衔接了如何将数量遗传学以及遗传评估软件与实践教学科研及生产紧密结合。我本人已通过Isik教授和原书出版社的授权组织翻译该书的中文版,并已跟科学出版社谈妥出版事宜。该书 ...
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提供数据分析服务-本帖长期有效
林元震 2018-10-10 15:11
本人从事林业统计分析,主编R与ASReml软件的教材2部,熟悉植物遗传评估,擅长R软件与ASReml软件。熟悉R编程,包括常见的基础统计(方差分析、协方差分析、t检验等)和高级统计(主成分分析、聚类分析、判别分析等);同时,也善于使用R软件进行图形的绘制,包括高级程序包ggplot2和lattice;此外,本人也在进行R程序包的编 ...
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R基本功之读取数据
林元震 2018-8-24 21:48
作者:林元震 数据是所有统计分析和图形绘制的基础,正如原料与菜谱之关系。数据读取正确与否,直接关系后续的统计分析结果的准确性,这好比原料新鲜与否,直接关系到后续菜肴的可口性。对于R初学者,尤其要重视数据的读取。本人主要从事林业统计分析,尤其是遗传评估,大部分涉及 ...
个人分类: R|2249 次阅读|没有评论
自交对植物遗传评估的影响
林元震 2018-8-22 15:08
作者:林元震 博文地址: https://yzhlinscau2018.netlify.com/programming/r/self/ 当亲本之一未知时,且物种可以自交,则需要在遗传评估中考虑自交的可能性。例如,对于桉树,假设自交概率为0.3是很普遍的。如果不考虑自交,则加性遗传方差将会被高估,因为子代并不都是半同胞 ...
个人分类: ASReml|1577 次阅读|没有评论
用R进行G×E互作的AMMI模型分析--2018-08-14
林元震 2018-8-14 11:49
作者:林元震 博文地址: https://yzhlinscau2018.netlify.com/programming/r/ammi-in-r/
个人分类: R|2643 次阅读|没有评论

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