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ASReml| R| breedR| python| 数量遗传学| Echidna|

置顶 · 提供数据分析服务-本帖长期有效（5月更新）: 2019-5-30 16:01; 本人从事林业统计分析，主编R与ASReml软件的教材2部，主译学术专著1部。熟悉植物遗传评估，擅长R软件与ASReml软件。熟悉R编程，包括常见的基础统计（方差分析、协方差分析、t检验等）和高级统计（主成分分析、聚类分析、判别分析等）；同时，也善于使用R软件进行图形的绘制，包括高级程序包ggplot2和lattice；此外，本 ...; 个人分类: R|4498 次阅读|没有评论

AAfun4包的所有函数及其功能: 林元震 2019-7-26 14:15; --------------------- 作者：yzhlinscau 来源：CSDN 原文： https://blog.csdn.net/yzhlinscau/article/details/97385205 版权声明：本文为博主原创文章，转载请附上博文链接！ AAfun4包是本人根据多年的遗传评估经验，基于asreml包开发的辅助程序包，用于增加一些辅助函数，实现一些特定的功能 ...; 个人分类: ASReml|2114 次阅读|没有评论

AAfun4包的新函数: 林元震 2019-7-21 11:36; https://blog.csdn.net/yzhlinscau/article/details/96703282 主要针对原有的**asreml.batch()**，增加了两个函数：**repin.batch**和**update.batch**，用于计算新的遗传参数，或者重新运行新的批量分析。最新版的asreml.batch()，基本上能涵盖常见所有的可用模型，比如家系模型，个体模型，空间模型，基因 ...; 个人分类: ASReml|1814 次阅读|没有评论

如何批量载入R程序包: 林元震 2019-7-19 11:54; 有时，我们需要载入一系列R程序包，如果仅使用library()来载入，需要写多次。下述代码，基本2行搞定。 pkgs-c('asreml','AAfun4','ggplot2') lapply(pkgs,library,character.only=TRUE); 个人分类: R|3337 次阅读|没有评论

AAfun4包的部分更新: 林元震 2019-7-19 11:40; 因科学网对程序代码支持差，具体博文请见下述网页： https://blog.csdn.net/yzhlinscau/article/details/96477198 注：最新的AAfun4包不再免费提供。; 个人分类: ASReml|1446 次阅读|没有评论

用R语言玩玩茅台股票: 林元震 2019-7-2 15:22; 本人不炒股，只是对R语言的分析一直感兴趣，加上偶尔会看看茅台酒的一些情况。最近，刚好看了一本用R语言量化投资的书，于是借用此书程序代码，玩玩茅台股票。仅供娱乐使用！切勿当真！因科学网对代码支持得差，感兴趣的，全文请见下述网页： https://blog.csdn.net/yzhlinscau/article/details/94444992 &nb ...; 个人分类: R|2521 次阅读|没有评论

R语言的使用体会: 林元震 2019-7-2 10:10; 从2012年接触R语言至今，已过去了7年。R语言一路在发展，版本也在不断地更新，程序包也源源不断地涌向。但最近2年，我发现，R语言使用起来有些麻烦，尤其当你更新R语言版本，或者买了新电脑外，重新安装R语言及其R程序包，有时就会发现程序包安装不了！之前能够使用的R包，不再工作了！此外，不同版本R包，有时与R语言不 ...; 个人分类: R|2757 次阅读|没有评论

一步法GBLUP(SS-GBLUP)的实施: 林元震 2019-7-1 21:04; 一步法GBLUP(SS-GBLUP)可综合利用基因分型数据和谱系文件的全部信息，进行基因组BLUP，获得更多可靠结果。AAfun4包最新版里添加了函数AGH.inv()，用于计算H矩阵的逆矩阵，可用于SS-GBLUP。简单示范如下： library(AAfun4) data(ugped)#未基因分型的谱系文件 data(gped)&nbs ...; 个人分类: ASReml|5285 次阅读|没有评论

林木基因型与环境互作的研究方法及其应用--综述: 林元震 2019-6-9 08:37; 林业科学 2019 , Vol. 55 Issue (5) : 142-151 DOI : 10.11707/j.1001-7488.20190516 摘要：我国是全球第一大木材进口国和第二大木材消费国，木材对外依存度已连续多年超过50%。然而，我国每公顷森林年均生长量约为林业发达国家水平的一半，这说明 ...; 个人分类: 数量遗传学|2773 次阅读|没有评论

生态R包spatstat的部分用法（三）--地形分析: 林元震 2019-1-7 11:20; 继续之前的帖子，下述代码主要是针对地形分析。 1. 地形数据读取 esdf-readxl::read_excel(data2.xlsx,sheet=1,skip=1) 2.地形因子生成 im 形式 ##选出海拔的数据 elev=esdf$meanelev ##将海拔数据转换为30行50列的矩阵 e=matrix(data=elev,nrow=30,ncol=50) ...; 个人分类: R|5070 次阅读|没有评论

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