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AAfun4包的新函数

已有 1566 次阅读 2019-7-21 11:36 |个人分类:ASReml|系统分类:科研笔记

https://blog.csdn.net/yzhlinscau/article/details/96703282  


主要针对原有的**asreml.batch()**,增加了两个函数:**repin.batch**和**update.batch**,用于计算新的遗传参数,或者重新运行新的批量分析。最新版的asreml.batch(),基本上能涵盖常见所有的可用模型,比如家系模型,个体模型,空间模型,基因组选择模型,及其多变量模型。


**repin.batch**用于计算批量分析结果的新参数,无需重新调用Asrem程序。


**update.batch**用于重新运行批量分析,只需输入相应的新模型项,比如固定效应、随机效应和误差效应等,无需重复输入原有的其它参数。同时,运行的新结果,可直接传递给**repin.batch**计算遗传参数。


## 1 repin.batch
用法:
 ```
 repin.batch(object, mulp, asrV = 4)
      -- object:批量分析运行的结果;
      --mulp:新的参数计算公式;
      --asrV:asreml版本,默认为最新版4.1。
  ```

## 2 update.batch
用法:
```
update.batch(object, FMod = NULL, RMod = NULL, EMod = NULL,
                          maxit = 30, asrV = 4)
      -- object:批量分析运行的结果;
      --FMod:新的固定效应;
      --RMod:新的随机效应;
      --EMod:新的误差效应;
      --asrV:asreml版本,默认为最新版4.1。
```
同时新运行的结果,可直接通过repin.batch计算遗传参数。简单示范如下:
```



https://wap.sciencenet.cn/blog-1114360-1190464.html

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