3月3日,《Nature Communications》在线发表了熊立仲课题组题为 “Translational repression by a miniature inverted-repeat transposable element in the 3′untranslated region” 的研究论文。该研究发现水稻中的一类DNA转座子具有翻译抑制功能。此研究使我们更深入了解基因组中转座子的生物学功能。沈建强博 ...
Magic-BLAST is a tool for mapping large next-generation RNA or DNA sequencing runs against a whole genome or transcriptome. 前面一段 时间看到NCBI上blast出了一个新系列,短序列的mapping。基本与blast使用体验一致。Magic-BLAST 也适用于长片段mapping,比如EST。最好调整默认的参数。 科学网博客 ...
The pangenome of hexaploid bread wheat 今天看到这样一篇文章,着实高兴了一番。在小麦参考基因组刚刚公布,文章还未发表的情况下,突然跳出了一篇小麦宏基因组的文章,让人不得不得感叹,这都是什么世道。匆匆看过一遍之后,有点失望,这分析也太简单了,怪不得只发在了The plant journal上,需要挖掘的信息很 ...