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小麦未知基因的快速克隆方法5—MutChromSeq技术
马省伟 2017-12-28 09:15
12 28 本期作者:阿飞 由于基因组巨大、重复序列多并且染色体存在大量的低交换率区域,大麦或小麦的图位克隆工作往往比较困难。对于基因组较小的拟南芥来说,通过对作图群体进行全基因组重测序,在不依赖于交换或重组的基础上,研究者很能容易地拿到目标基因。但在基因组较大的大麦或 ...
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再说基因组注释
马省伟 2017-12-26 17:13
12 27 本期作者:Neal 上次我们提到这个文献 “ The state of play in higher eukaryote gene annotation ” ,建议大家去看看了解下,不清楚有多少人会看。基因组注释这一块内容99%的人都不会用到,因为注释出的内容绝大数都是正确的。但是一旦已有的注释信息不能满足需求,那就需要 ...
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利用近等基因系进行RNA-Seq定位目标QTL——论材料的重要性
马省伟 2017-12-21 16:17
利用近等基因系进行RNA-Seq定位目标QTL——论材料的重要性 时间都去哪了?在昏沉的下午,胖丫望着实验室一众忙碌的身影,有点茫茫然。2017年就走到头了,又是不堪回首的一年。跟着我 左手右手 一个慢动作,一年到头休息的日子就数过来了,而看看取得的成果貌似一只手都绰绰有余。前几日师兄调戏胖丫说,2017胖丫最重要 ...
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如何搭建一个网页版的BLAST服务器
马省伟 2017-12-20 16:57
如何搭建一个网页版的BLAST服务器 胖丫今天跟我说:“师兄,再来给我调调网络呗?公共BLAST服务器太慢了,半天刷新不出来!”我说:“我们这是百兆宽带到桌面,刷新慢不是网络的问题,是你离人家的服务器太远了!L”胖丫一脸委屈的说:“要不我去人家有服务器的实验室申请个博士读读?”“……” 不知道大家平时用公共B ...
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SPSS中正态分布验证、方差齐性检验以及Wilcox检验
热度 1 马省伟 2017-12-18 10:44
SPSS中正态分布验证、方差齐性检验以及Wilcox检验 t检验或方差分析要求数据正态分布以及方差齐性。一般来说我们的表型数据符合正态分布以及方差齐性的要求。但对于其他类型的数据,就不一定满足这两点了。所以在进行t检验和方差分析之前,首先要进行数据的正态检验以及方差齐性检验。在SPSS中的具体操作如下: 输入的数据 ...
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小麦GWAS思路总结-2
马省伟 2017-12-18 09:04
小麦GWAS思路总结-2 首先感谢上次小伙伴们积极参与话题的讨论,其实关于Manhattan图那个问题是我毕业答辩的时候一个美国教授问我的,我在他的循循善诱之下终于回答出来了。另外,有一位小伙伴留言说“One of the biggest limitation of GWA approach is the spurious association, I think one can never get over” ...
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基因组解读---蛋白编码基因的注释
马省伟 2017-12-16 14:33
按惯例说点其它的,我们的小萌萌建议我们将更新时间设置在晚上十点,但其实一直没改动, 还是零点更新。胖丫说,臣妾做不到啊 。现在有不少人关注了很多公众号,在众多的公众号里,想要找到我们还真不容易。这里告诉大家如何置顶公众号。简单来说,就是长按公众号,弹出页面,点击“置顶公众号”,如下图。 &n ...
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寄主介导的基因沉默技术(HIGS)在小麦抗条锈病上的应用
马省伟 2017-12-14 13:21
随着技术的进步,小麦的反向遗传学研究目前也取得了可喜的进展。近日题为“ Host-Induced GeneSilencing of the MAPKK Gene PsFUZ7 Confers Stable Resistance to Wheat StripeRust ”发表在 Plant Physiology 上,通讯作者是 康振生院士 和 郭军 教授。小编有幸邀请到该文 ...
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TE煮沸法快速获得可扩增DNA
马省伟 2017-12-1 09:20
非常感谢何老师的分享 。 近期sci-hub.cc不能访问了,大家可以试试下面的两个网址: 1、 https://scihub22266oqcxt.onion.link 2、 https://sci-hub.bz TE 煮沸法快速获得可扩增 DNA 何华纲 近日盟主推送了“史上最快核酸提取方法,30秒内完成”,这里跟大家分享一下我们实验室使用 ...
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