如果要从事计算机系统结构学科方面深入研究，良好的数学基础是必需的，这样才能够从容地从事系统结构学科研究，根据笔者多年阅读文献和研究工作的体会，一般应该掌握：数学分析、线性代数、矩阵分析、概率论、随机过程、排队论(包括连续排队和离散排队)、组合数学、抽象代数、图论、Petri网、优化方法(包括传统优化方法和智能优化方法)等。特别概率类数学基础(概率论、随机过程、排队论等)在计算机系统结构学科中应用特别广泛。通过笔者阅读该学科顶级期刊"IEEE Transactions on Computers“、"IEEE Transactions on Parallel and Distributed Systems“、"IEEE Transactions on Networks"上计算机系统结构学科相关文献发现，具有这些数学基础和计算机系统结构相关专业知识，一般都能够理解这些文献内容。