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RNA语言模型也来了!
热度 2 周耀旗 2023-11-10 21:09
最近语言模型ChatGPT在回答各类问题的范围、深度和准确度上的革命性进展,掀起了开发通用大语言模型的热潮。与此同时,这些语言模型在生物高分子蛋白质上的应用也在不断深入,已经有二十多个不同规模、不同应用的模型问世,在蛋白质结构和功能预测、以及蛋白质设计上发挥出越来越大的作用。与有20个氨基酸组成的蛋白 ...
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[转载]3=1+2:分割是如何攻克蛋白质结构预测的?下一步将走向何方?
周耀旗 2023-10-19 10:06
导读:近日,深圳湾实验室周耀旗课题组在 National Science Review 上发表综述展望: “3=1+2: How the Divide Conquered de Novo Protein Structure Prediction and What is Next? ”(3=1+2:分割是如何攻克蛋白质结构预测的?下一步将走向何方?),作者用通俗易懂的比喻讲述了 AlphaFold 的来龙去脉。 自从 ...
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打破RNA二级结构预测精度的天花板
周耀旗 2019-11-28 13:37
在生命体系里,RNA长期以来被认为是蛋白质的小弟,因为除了转运RNA(tRNA),核糖体RNA(rRNA),把信使RNA(mRNA)按照DNA指定合成特定的蛋白质之外,以后就没有RNA的什么事了。只有各种蛋白质,才是忙上忙下,包揽一切的万能手。但是,近年来越来越多的实验表明RNA似乎无处不在、无所不能,有用于RNA修饰的(例如snRNA, ...
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世界前10万科学家排名出来了,里面都有谁?
热度 17 周耀旗 2019-9-8 21:15
我们见识过了各种各样的大学排名,比较出名的有美国的News World Report,英国的泰晤士报THE/QS,还有上海交大的ARWU。不同因子的权重不一样,导致大学排名在不同的排名榜里不太一致。显然各个大学的办学理念不一样,大学内的各学科发展水平也不一样,用一个分数来代表,自然是简单粗暴,但对于广大学生和家长来说, ...
个人分类: 科技推广|29500 次阅读|24 个评论 热度 17
诚邀合作、一起建立高影响力的大数据
热度 3 周耀旗 2018-5-16 06:40
如 果你有论文被 PUBMED 索引,我们邀请你加入 RELISH 联盟, 访问 https://pubmed.ict.griffith.edu.au/register , 标注 60 篇文章与你自己论文的相关性,一起共建相关文献的标准大数据库,并成为描述该数据库论文的贡献作者。 作为一个科学 ...
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《自然》杂志的读者来信与科学网博文影响力的比较
热度 6 周耀旗 2017-9-19 09:55
不久前( 7月25日)我写了一个博文 《 快速搜寻到与你的 PubMed索引论文所相关的文章 》 ,有幸被编辑精选了。这篇博文介绍我们研究组正在发展的不需要用关键词进行 PubMed文献搜索的一个网站( http://pubmed.ict.griffith.edu.au )。网站自动从题目和摘要生成关键词,免去该用什么关键词搜 ...
个人分类: 科技推广|13803 次阅读|8 个评论 热度 6
呼吁大家和我们一起共建精准搜索PubMed 所需的相关文献标准数据
热度 6 周耀旗 2017-8-14 12:02
我们呼吁大家和我们一起共建精准搜索 PubMed 所需的相关文献标准数据库。长期以来,由于相关文献标准数据库的缺乏,文献检索的方法无法进行比较,更谈不上大的改进了。为了获得这样的标准数据库,我们已经在 http://pubmed.ict.griffith.edu.au/ 上建立了基于论文的 PubMed 搜索引擎 ...
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