当我们做过渡态时可能生成很多POSCAR 这些POSCAR 都需要去固定 一个一个去固定很麻烦 比如你查15个点 有15个文件夹里的POSCAR 去固定。 我找了一天,找到了用sed 命令去批量固定原子,等操作 指定行尾添加F F F for i in {1..16} ;do cd $i ; sed -i '10,63s/$/ F F F/g' POSCAR ; cd .. ; done 指 ...
ase 可以建模 ,切晶面 ,扩胞等一系列操作十分方便 第一步建模 通过ase 可以读取POSCAR xyz 等文件, 就直接建模了,十分方便。也可以自己搭建模型。也可写出文件,这个功能可以转换文件格式 ase.visualize 可以查看原子结构 import ase from ase.io import read ,write from ase.visualize import view ti ...