科学网

 找回密码
  注册
三年孕育出一个R包,用代码画蛋白结构域和突变位点
王程扬 2018-5-9 10:52
本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权。查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow-genome 作者:小丫 来源: 嘉因 小丫画图群里有位小伙伴想众筹画这种图的代码:希望能显示蛋白结构域和突变位点。 或 这种图的用途很广泛, 没有R包吗?这不科学 。 google搜“ ...
个人分类: 生信画图|7021 次阅读|没有评论
错过它就像错失了一个亿!研究转录调控,比ENCODE更实用
王程扬 2018-5-9 10:45
本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权。查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow-genome 作者:小丫 来源: 嘉因 今天遇到小伙伴要 找转录因子A的靶基因 ,我顺理成章的打开 史上 最全 的 ChIP-seq数据库cistromeDB ,查看里面有没有转录因子A的ChIP-seq数据。 咦?右侧出现 ...
个人分类: 转录调控|4974 次阅读|没有评论
我把Nature的Figure画成了蒙娜丽莎
王程扬 2018-4-26 15:56
本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权。查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow-genome 作者:小丫 来源: 嘉因 小伙伴们看了《 把Cell爆文的思路、方法用到自己的研究中 》都想知道: 找关键转录因子的这个图是怎么画的? 为了解决这个问题,小丫发起了接力活动: 第一棒 ...
个人分类: 生信画图|3996 次阅读|没有评论
CNS最爱的配色,在网页上点鼠标就能抓到 | 接力第四棒
王程扬 2018-4-26 15:02
本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权。查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow-genome 作者:小丫 来源: 嘉因 小伙伴们看了《 把Cell爆文的思路、方法用到自己的研究中 》都想知道: 找关键转录因子的这个图是怎么画的? 为了解决这个问题,小丫发起了接力活动: 第一棒 :小丫提 ...
个人分类: 生信画图|6228 次阅读|没有评论
Cell的模式图画反,反,反了
王程扬 2018-4-25 16:52
本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权。查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow-genome 作者:小丫 来源: 嘉因 最近最火的莫过于Cell上的一系列TCGA paper,新朋友可能对挖掘TCGA数据的工具感兴趣《 TCGA,她已经用了七年 | 资深用户深度点评 》。小丫最感兴趣的是下面这篇,因为它讲了 ...
个人分类: 生信画图|4138 次阅读|没有评论
RNA-seq居然能挖出这么多机制!给你的文章加5分
王程扬 2018-4-25 16:39
本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权。查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow-genome 作者:小丫 来源: 嘉因 手里有RNA-seq数据,不甘心发5分,想加点 机制 ,发10分。下面的 思路 ,总有一款适合你: RNA-seq数据 + 别人的ChIP-seq数据,准确 找到靶基因 ,详见《 RNA ...
个人分类: 生物信息|10194 次阅读|没有评论
这些年的讲座ppt都白攒了
王程扬 2018-4-25 13:17
本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权。查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow-genome 作者:小丫 来源: 嘉因 看完《 再次把Cell爆文的思路、方法用到自己的课题上 》,跟我要梁晗老师ppt的小伙伴儿,有谁认真看了ppt?有多少收获? 小丫翻看了几个ppt,完全没印象,好像当年没听过课 ...
个人分类: 生物信息|2418 次阅读|没有评论
用同样的工具画图,卖家秀Nature communications
王程扬 2018-4-25 12:53
本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权。查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow-genome 作者:小丫 来源: 嘉因 小丫经常介绍一些好用的工具,例如整合了eQTL、DNase-seq、ChIP-seq数据和motif分析的检索工具HaploReg和Regulome,用它们查询SNP对转录调控的影响、挖掘变异导致表型变化的 ...
个人分类: 生信画图|3798 次阅读|没有评论
神技能!转录调控必读
王程扬 2018-3-28 15:03
本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权。查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow-genome 作者:小丫 来源: 嘉因 转录调控的经典问题: 哪个蛋白质调控我感兴趣的基因? 为了帮助小伙伴儿解决这个问题,小丫写了系列技术贴: ChIP系列Plan A:点鼠标就能实现的 1234 、用代码实现的 56 ...
个人分类: 转录调控|4671 次阅读|没有评论

本页有 1 篇博文因作者的隐私设置或未通过审核而隐藏

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2024-4-23 15:23

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部