从"本手、妙手、俗手"的角度谈谈生物信息

陈成 2022-6-7 16:43

关于生物信息我的拙见：本手是学好遗传学，数理统计学，熟悉各类数据库，文件结构，掌握一门编程语言如python。妙手是掌握各类算法，会使用多种编程语言如Perl，R，C/C++, Java等，以满足不同的使用场景。同时，读写能力强，可无障碍阅读各类英文资料。俗手是只会在线blast...

个人分类: 生物信息学|1502 次阅读|没有评论

面向对象与递归实现DNA序列反向互补(二)

陈成 2022-5-7 10:28

序列反向和反向互补是进行生物信息分析的常见做法。为了实现序列的反向和者反向互补，可以采用不同的方法。这里使用python语言，采用面向对象编程的for...loop结构和面向对象编程的递归（recursion）实现序列的反向与反向互补。关于面向对象编程（ Best Practices of ...

个人分类: 生物信息学|1736 次阅读|没有评论

面向对象与递归实现DNA序列反向互补

陈成 2022-5-4 16:10

序列反向和反向互补是进行生物信息分析的常见做法。为了实现序列的反向和者反向互补，可以采用不同的方法。这里使用python语言，采用普通的for...loop结构和递归（recursion）实现序列的反向与反向互补。关于面向对象编程（ Best Practices of Object Oriented Programming (OOP) - GeeksforG ...

个人分类: 生物信息学|2153 次阅读|没有评论

【Science】重大突破！小麦产量性状新基因被发现

陈成 2022-4-8 13:49

恭喜我的导师贾海燕老师的研究成果在Science上发表，多年的积淀和辛勤付出，终得回报。通过图位克隆的方法，分离得到的TaCOL-B5基因，能够显著提高小麦产量。成果喜人，应用前景广阔。真是鼓舞人心，令人激动的杰作。纵观Liuling Yan教授所发表的一些文章，可以看出，其很多经典的工作（PNAS，200 ...

1410 次阅读|没有评论

Zotero使用说明

陈成 2017-12-10 23:50

2017-12-10 一、简介： zotero是开源的文献管理工具，可以方便的收集，组织，引用，和共享文献的工具。由安德鲁·w·梅隆基金会，斯隆基金会以及美国博物馆和图书馆服务协会资助开发。支持Windows，MacOS,及Linux操作系统。 二、下载网站： Zotero可在（ https://www.zotero.org/download/ ）上进行下载，如 ...

7379 次阅读|1 个评论

perl根据列合并多个文件（不超过5个）

陈成 2017-12-6 15:24

#!/usr/bin/perl -w use strict; #=============================================================# # Function: This script is used to combine files (not more than 5) together according # # their columns for the snp variant type . &nb ...

3951 次阅读|没有评论

get_LOD_peak.pl(MapQTL6.0)

陈成 2017-3-9 15:19

#!/usr/bin/perl -w #=============================================================== # This script is used to extract the LOD value of a batch of files at 95% informative interval for MapQTL # By chencheng hengbenxianfeng@163.com # Start time: 2017/3/6 19:40 # End time: 2017/3/6 20:10 # Title ...

3833 次阅读|没有评论

get_GC_N50_N90.pl

热度 1 陈成 2017-3-3 16:15

#!/usr/bin/perl -w use strict; # This script is used to calculate the Scafford length,GC content,N50,N90, and reference length,reference GC content of # a species's genome,which has a fasta format. #================================================================================= # by Chen ...

3774 次阅读|6 个评论 热度 1

本页有 2 篇博文因作者的隐私设置或未通过审核而隐藏