homologs, orthologs 和 paralogs，傻傻分不清楚？

范欢 2021-6-24 21:14

小时候中央六放过一个国产动画，讲古博士和杜博士发现但不认识苍蝇，认为是一个新物种，命名为 “古普斯·杜勃斯·希里渥图斯” 。小朋友一听：古博士，杜博士，稀里糊涂死。名词术语，自然有其存在的道理，所谓名不正则言不顺。但有些术语确实是大同行看了沉默，小同行看了流泪。比如Homologs, orthologs, paralogs这三个 ...

个人分类: 进化|11728 次阅读|没有评论

长大后我就成了root - Docker入门

范欢 2021-6-14 15:23

​Docker类似（但不是）虚拟机，能为某一个/一系列软件构建一个自己的宇宙/环境，让不同的软件之间不用相互影响，为用户解决所需下级软件/包/库的版本依赖。 现在很多软件都提供了Docker的安装方式。 现以基因预测软件augustus(https://github.com/Gaius-Augustus/Augustus)为例，介绍其使用方法。 首先保证 ...

个人分类: 生信|1663 次阅读|没有评论

宏基因组序列的抗菌潜力预测

范欢 2020-10-14 11:10

本文收到了刘尧老师（公众号：生信小白鱼）《 列举一些次级代谢物基因簇相关的数据库 》一文的很多益处，在此感谢。 此次要完成的任务是根据宏基因组序列预测这个群落的抗菌潜力。 输入：宏基因组clean reads 输出：antimicrobial potencial prediction (如何量化待定） 之前的工作涉及细菌的全基因组测序和功能 ...

2398 次阅读|没有评论

本页有 1 篇博文因作者的隐私设置或未通过审核而隐藏