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2021年如何查询期刊的影响因子?保姆级教程
苏威 2021-7-20 17:54
影响因子的简介 影响因子(英文:Impact Factor),简称 IF ,是 汤森路透 (Thomson Reuters)出品的期刊引证报告(Journal Citation Reports, JCR )中的一项数据。 即某期刊前两年发表的 论文 在该报告年份(JCR year)中被引用总次数除以该期刊在这两年内 ...
个人分类: 期刊|32150 次阅读|1 个评论
批量将seq格式文件转为fasta格式文件
苏威 2021-7-17 10:22
需要软件:DNASTAR,cygwin及可靠的大脑,哈哈哈哈! 第一步利用DNASTAR下的EditSeq将多个seq格式文件转为一个fasta文件。 直接拖入,选择just open 点击file-export all to one,导出为all.fasta文件 第二步,将all.fasta文件分解为单个fasta文件 运行seqkit split -i all.fas即可 至此将seq文件批量转 ...
个人分类: 软件|10034 次阅读|没有评论
物种内circos图的绘制
苏威 2020-9-10 19:56
分析内容及数据准备(以油菜为例) 1. 基因组共线性分析:数据包括 zs11.all.v0.cds (油菜基因组cds文件), zs11.v0.gff3 (油菜基因组注释文件),所有工具为python版的MCscan( JCVI包 )。 2. Circos图绘制:数据包括染色体核型文件karyotype.txt,需要突出展示genepair文件link.txt,染色体共线性区间文件genome.block ...
个人分类: python|6166 次阅读|没有评论
VBox虚拟机中,deepin系统下共享文件夹
苏威 2020-6-9 19:38
前言: 首先你需要在windows中安装了虚拟机VirtualBox( 下载地址 ),在虚拟机中安装了备受推崇的linux系统Deepin( 下载地址 )。还是三步法解决如何共享文件夹的问题,有问题请留言或者请指教。开始了-------------------------------------------------------------------------------- ...
个人分类: 软件|3685 次阅读|没有评论
windows下diamond快速比对蛋白质序列
苏威 2020-6-9 19:09
第一步:建库 使用命令diamondmakedb--in建库文件.fa--db输出文件名称 E:\Util_file\diamond-windowsdiamondmakedb--inBrassica_napus.annotation_v5.pep_rename.fa--dbBra ssica#建库示例命令 diamondv0.9.32.133(C)  ...
个人分类: 软件|4316 次阅读|没有评论
conda安装本地格式为zip包
苏威 2020-5-3 18:19
最近在台式机上安装了windows版本下的Miniconda,遇到了一个问题,如何安装本地的zip格式的包。 从PyPI上下载的包格式为:.zip 第一步:列出虚拟环境 condainfo--envs 第二步:切换到包所在目录 cd路径 第三步:安装包 解压缩包,里面有一个setup.py文件 pythonsetup.py&nbs ...
个人分类: python|6382 次阅读|没有评论
pip批量卸载Python安装包
苏威 2020-4-30 13:33
第一步: 桌面按Shift并右击鼠标,打开命名行模式,输入 c:\Users\asuwei\Desktoppipfreezepackages.txt 这将会创建一个 packages.txt文件,其中包含了当前环境中所有包及各自的版本的简单列表(即pip list 所列出的包列表) 第二步: packages.txt内容显示如下: DateTime==4.3 ...
个人分类: python|3099 次阅读|没有评论

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