科学网—niuneat的博文

置顶 · 升级版|16srRNA微生物多样性测序报告解读

2021-4-1 17:29

微生物多样性测序（扩增子测序）是基于二代高通量测序对16S/18S/ITS等序列进行测序。可以同时检测样本中的优势物种、稀有物种及一些未知物种的检测，获得样本的微生物群落组成以及相对丰度。相信关注我们的小伙伴对此并不陌生。这次我们整合了大家平时会遇到的一些问题，在原有的基础上对报告进一步完善。 ...

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置顶 · [转载]多快好省的宏基因组研究技巧 — 资深专家分享

2020-4-27 13:34

谷禾健康原创近年的研究热点集中于环境和生物体相互作用的微生物群体，而大量复杂的微生物群体存在培养困难，构成复杂（包括细菌、古菌、真菌、原生生物、病毒甚至小型真核生物）。因此如何用高通量精准的了解这些群体的构成，基因功能分布以及具体的表达活性和代谢状况成为首要问题。高通量测序技术 ...

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置顶 · [转载]微生物多样性测序结果如何看？

2019-11-18 14:37

原文如何读懂和利用你的微生物多样性测序结果？谷禾健康原创做过16s测序的小伙伴们都知道测完之后会拿到一份结果报告但这并不代表可以开始写文章了看似一大堆数据图表却不知如何下手这是很多人头疼的地方那么怎样给报告中的数据赋予灵魂让它真正成为对你有帮助的分析呢？今天我们来详细解 ...

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[转载]肠道神经免疫轴：神经元、免疫细胞和微生物之间的串扰

牛耀芳 2025-7-12 17:32

在自然界中，一些引人注目的共生现象出现在能够改变宿主行为的微生物与其宿主之间。细菌沃尔巴克氏体（Wolbachia pipientis）如同生物基因木马，能够操控昆虫的生殖和神经系统；狂犬病毒（Rabies lyssavirus）感染宿主中枢神经系统后，几乎以100%的死亡率展现其致命威力；偏侧蛇虫草菌（Ophiocordyce ...

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[转载]久治不愈的疼痛，基于肠道菌群调节的科学依据与临床前景

牛耀芳 2025-7-12 17:27

慢性疼痛已成为困扰全球五分之一成年人的重大公共卫生挑战，表现为一种复杂的、多维度失调的病理状态，深刻影响患者的生理、心理乃至社交。这一持续3个月或更长时间的疼痛现象，呈现出锐痛、刺痛、灼烧感、酸痛等多样化特征，可能局限于特定部位或广泛分布全身，因其易于复发的特性，给个人、家 ...

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[转载]肠道微生物的营养获取策略：一个隐秘而精妙的生态系统

牛耀芳 2025-7-12 17:23

人体复杂的内部环境中栖息着种类繁多、功能各异的微生物群，这些微生物群落对人类的基本生理功能和各种疾病状态都产生着深刻而持续的影响。人类胃肠道系统代表着宿主机体与宿主相关微生物群落之间最为重要和最大规模的生物接触界面。长期定植于这一特殊环境中的常驻细菌群体，经过漫长的进化历程，已经 ...

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[转载]多囊卵巢综合征的肠道菌群-代谢轴：从内分泌紊乱、排卵障碍到肥胖脱发的病理生理联系

牛耀芳 2025-7-12 17:00

门诊室32岁的林女士第三次向医生说自己的困扰：月经周期紊乱、体重莫名上升为什么运动和饮食控制对我的症状收效甚微？ ... 多囊卵巢综合征多囊卵巢综合征（PCOS）是一种常见的主要影响生育力的妇科内分泌疾病。其特征为月经不调、雄激素水平升高、排卵功能障碍等。据柳叶 ...

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[转载]植物多糖代谢专家——卵形拟杆菌(Bacteroides ovatus)影响神经递质水平及健康

牛耀芳 2025-7-11 18:03

拟杆菌属下有众多成员，而卵形拟杆菌 ( Bacteroides ovatus )正是其中一员，它是一种革兰氏阴性、严格厌氧、不形成孢子的细菌。作为肠道微生物群中的主要菌种之一，它存在于约 80% 健康人的胃肠道中，对宿主健康具有重要影响。卵形拟杆菌 ( B .ovatus )展现出极其多样化的碳水化合物代谢能力， ...

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[转载]人体微生物进入临床应用转化的潜力和障碍

牛耀芳 2025-6-9 15:54

在过去十年中，临床微生物组研究的格局发生了巨大变化。通过利用体内和体外实验、多组学方法和计算生物学，发现了许多详细的作用机制和微生物关联指标，并确定了在许多疾病和治疗方式中改变微生物组的有效方法。尽管微生物组领域的临床转化仍处于早期阶段，其基础性发现正稳步为医疗领域带 ...

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[转载]广泛存在于人群的双面使者——Prevotella copri与疾病和健康

牛耀芳 2025-6-9 15:48

普氏菌( Prevotella copri )是普雷沃氏菌属(Prevotella)的主要物种之一，在人群中广泛存在，尤其是在口腔和胃肠道中。它是一种革兰氏阴性、厌氧、非孢子形成细菌，是许多个体胃肠道中重要的参与者之一。注：谷禾数据库显示超过98%的人群肠道粪便样本检出该物种 Prevotel ...

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[转载]肠道菌群：影响癌症的发生、发展和治疗

牛耀芳 2025-6-9 15:43

癌症——这个困扰人类几个世纪的疾病，至今仍是全球死亡率最高的疾病之一。国际癌症研究机构调查显示，2022年，全球有超过 1900 万新诊断的癌症病例和近1000 万癌症死亡病例，无数家庭因此经历痛苦。癌症是一种复杂的多步骤慢性疾病，由活跃分裂细胞在 DNA 复制过程中获得的自发突变积累而成，环境 ...

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[转载]当守护者越界：短链脂肪酸的生理保护与潜在破坏作用

牛耀芳 2025-6-9 15:17

肠道微生物群通过代谢发酵膳食纤维等不被人体直接吸收的物质，产生了一类重要的代谢产物—— 短链脂肪酸。短链脂肪酸主要包括乙酸盐、丙酸盐、丁酸盐，它们不仅仅是肠道上皮细胞的重要能量来源，更是联结肠道-免疫-代谢-大脑轴的信号分子。通过与特定受体(如GPR41/GPR43)结合，它们能调节肠道蠕动、维护肠 ...

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[转载]当守护者越界：短链脂肪酸的生理保护与潜在破坏作用

牛耀芳 2025-6-9 15:17

肠道微生物群通过代谢发酵膳食纤维等不被人体直接吸收的物质，产生了一类重要的代谢产物—— 短链脂肪酸。短链脂肪酸主要包括乙酸盐、丙酸盐、丁酸盐，它们不仅仅是肠道上皮细胞的重要能量来源，更是联结肠道-免疫-代谢-大脑轴的信号分子。通过与特定受体(如GPR41/GPR43)结合，它们能调节肠道蠕动、维护肠 ...

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