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在短短的三年里,CRISPR 已经被证明是对真核细胞进行精准基因编辑的最有效的工具。在最新一期《cell》(15 Jan2016)上,MIT 的著名生物学家Eric S.Lander 详细记述了这项生技的起源和演变的来龙去脉。 Lander 是一个具有数学教育背景的天才科学家。他是早期的人类基因组工程的领军人物。他不仅是卓越的科研人才,也是一位优秀的教育家。Lander上传到youtube 网站的分子生物学课件不是一般的清楚。没有生物背景的生物信息人员可以听他的课学习一些生物的基础。
这篇文章只有11页,但清楚地记述了CRISPR的历史。所讲到的事实是从发表的文章,对有关人员的访问和其他资源(包括期刊的拒稿信)中挖掘出来的。很可能是将来诺奖委员会筛选得奖人员的重要依据。这篇文章反映下列几个有趣事实:
1.小期刊,大发现。最早从事和CRISPR有关研究的科学家包括西班牙的Francisco Mojica 和法国的Giles Vergnaud。 在2003 和2005 这三年里,Mojica 的文章相继被 Nature,PNAS, Mol.Microbiology, NAR 拒稿,最后在J. Mol. Evolution (1/2005)上发表。Vergnaud的文章相继被 PNAS,J. Bacteriology, NAR, Genome Res. 拒稿。最后在Microbiology (3/2005) 上发表。 如果没有这些小期刊,也许就没有许多这种偶然得出的重大发现。
2.CRISPR的发现说明了非假设驱动研究(即大数据模式)的重要性。发现CRISPR 剪切DNA 而非RNA 的功能是完全从对病毒,细菌的基因序列的挖掘分析得出的。
3.CRISPR的发现也说明了生物信息学研究的重要性。由于他所在学校的设备有限,Mojica 在发现CRISPR位点(locus)的短序列重复结构之后便使用序列比对的方法得出重复序列之间的间隔序列其实是病毒和细菌的结合性质粒,从而揭示了它的适应性免疫功能。
http://www.cell.com/cell/abstract/S0092-8674(15)01705-5
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GMT+8, 2024-10-20 02:15
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