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#R语言下载序列并统计序列长度及物种信息
#作者信息 熊荣川 六盘水师范学院生物信息学实验室 |
#预装函数(此函数代码将在发布24小时之后删除) Down.seq <- function(File.accession){ …… } |
#使用方法
path = "……" #工作目录,存放你的序列清单文件的地方 setwd(path) #进入工作目录 File.accession = "dataBlist.txt" # 序列清单文件,须为txt格式 Down.seq(File.accession) #运行,结果是一个名为dataBlist的文件夹中有你要下载的序列和一个名叫“seqinfo.csv”的表格文件,文件中有序列对应的物种、序列长度等信息。
注意,你的R平台上需要预装ape和seqinr两个包。
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GMT+8, 2024-10-19 21:59
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