19世纪到20世纪，形成生物系统的实证与综合方法，建立了进化论、系统论与结构论的理论基础，从经典遗传学、分子遗传学发展到系统遗传学，及其系统医学与系统生物工程应用。

从莱布尼兹的数理逻辑和计算器、康德的综合思维和图式概念，到欧拉的图论、庞加莱的拓扑学和胡塞尔现象学等，以及心理物理学、心理生物学和发育与进化生物学等，进入了系统科学与哲学的发展时期。

20世纪中叶，系统生物学词汇和数学、理论生物学建立，认知科学和计算机技术、分子生物学与纳米生物技术的发展等，导致了理论、计算与实验、工程方法的生物系统研究和人工生物系统设计成为可能，同时，中西医学与科学、中西哲学与艺术等探讨，导致了生物系统机理与人工机器的哲学思考。

19世纪，实验医学和实验生理学、生物化学等建立，20世纪，生物物理学和生物技术等发展。中医药学，属于工程范式的实践、经验与哲学理论的体系和人体机能、图论模型方法，不同于实验医学的机体器质解析、药物的化学分析方法。

然而，在哲学和方法论层面，在细胞分子系统、细胞通讯网络和器官系统等，及其与生态系统的关系和“社会-心理-生物”医学模式等层面，可以将中医药学和实验医学转换到系统医学与药物学的发展方向。

如，生态系统的“水”、“火（阳光）”、“土”、“木（植物）”、“金（空气）”，器官系统的消化、呼吸、泌尿与血液循环的代谢稳态和“神经-内分泌、免疫”系统的调控到细胞分子系统的网络拓扑学模型等，通过分析相关药物配方，发现配伍也是针对人体的机能模型设计。

-（总结）-