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bam 转 bedgraph
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有两种方法可以将bam转成bedgraph
方法1:
samtools view my.bam > my.sam
wiggles my.sam my.wiggles.bedgraph
方法2:
samtools sort my.bam my.sorted.bam
genomeCoverageBed -bga -ibam my.sorted.bam -g chrom.sizes >my.bedtools.bedgraph
https://wap.sciencenet.cn/blog-1509670-847332.html
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