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转录组的怪事:嵌合RNA

已有 5624 次阅读 2014-11-29 23:17 |个人分类:【转录组-mRNA分析】|系统分类:科研笔记

嵌合RNA(chimeric RNA)由两个或两个以上基因的外显子组成,并具有编码新蛋白改变细胞表型的潜力。嵌合RNA就是命名于合成神兽奇美拉的。迄今为止研究人员已在多种生物体中通过高通量RNA测序,识别了大量可能的嵌合转录本。


嵌合RNA的形成机理,多数人认为是与tran-splicing有关。  tran-splicing (反式剪接):内含子的剪接一般都是发生在同一个基因内,切除内含子,相邻的外显子彼此连接,称为顺式剪接(cis-splicing),但也有另一种情况,即不同基因的外显子剪接后相互连接,此称为反式剪接(trans-splicing)。反式剪接的情况较为稀少,较典型的例子是锥虫表面糖蛋白基因VSG(variable surface glycoprotein)、线虫的肌动蛋白基因(actin genes)以及衣藻(chlamydomonas)叶绿体DNA中含有的psa基因。


“嵌合的RNA(Chimeric RNA)”以及它们的编码产物通常都是
导致肿瘤发生的原因之一。不过这些分子在正常的细胞中也经常会有低水平的表达。我们以前一直认为这些分子是由于DNA重排产生的,现在才弄清楚,在一些正常细胞内会经常发生RNA反式剪接作用,正常的细胞中也会鉴定到一些嵌合的RNA,他们的功能有待进一步挖掘!


在线视频--嵌合RNA详述
http://v.youku.com/v_show/id_XNDQ2NDYyNzcy.html




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