这台电脑里没有我的资料，正好我凭自己的感觉写点东西。说说QTL作图。QTL作图有3个要素。作图群体，基因型，表型。其实就这么简单。作图群体有：F2、DH、RIL等（这里列举的是基于两个亲本的分离群体的QTL作图，当然作图群体也可以是关联作图群体，用关联作图方法同样可以检测QTL）。基因型和表型，当然都是指作图群体的基因型和表型。这基本上是QTL作图的全部了，复杂吗？至少我没感到它是复杂的。一般的QTL作图基本都不屑一看。这里的作图的概念，其实是QTL粗定位，也即把QTL定位在以cM为单位的区间内，这个区间包含N多基因。我更加关注QTL和表型的一一对应关系即QTL的图位克隆。所谓图位克隆一般要粗定位、精细定位、再进一步细化、确定候选基因这样一个过程。这是目前QTL图位克隆的主要思路。再回到三个要素作图群体、基因型和表型。在现在及将来的技术条件下，基因型可能不会是什么问题，因为低成本的全基因测序的时代正逐渐成熟，估计将来基于测序的基因型鉴定将成为一种主流的方法。所以关键是作图群体和表型鉴定，可能表型鉴定尤其重要，所以我还是要做原来我的博客中做过的基本判断：表型时代到来了。当然作图群体也非常关键。我个人倾向于大群体的永久作图群体，而作图群体的培养是需要时间的。在高密度遗传图谱，及大群体的条件下，有可能直接实现QTL精细定位。原来的模式为：粗定位+精细定位+侯选基因+QTL控制基因，可以是精细定位+侯选基因+QTL控制基因，甚至通过作图可以直接确定侯选基因。当然前提是高密度遗传图谱，准确的表型鉴定，足够大的作图群体（最好是永久作图群体，这样能在不同环境条件下进行重复的表型鉴定）。高密度遗传图，这实际上是出钱就能办的事。可能最关键的还是作图群体。有了作图群体，关键是在表型鉴定。

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