InDel is used to mean an insertion or a deletion. 最近用novoalign(
http://www.novocraft.com/)软件做了InDel的开发,novoalign可以找到长达7bp的InDel(
http://seqanswers.com/forums/showthread.php?t=327),参数设置为InDel长度4bp以上,重复4次以上。然后用PAGE胶检测20个样本,居然没有一个InDel能很好地检测出来,在PAGE胶上的差异不大。可能是软件问题,也可能是PAGE胶的浓度过低,没有被检测出来。
https://wap.sciencenet.cn/blog-442719-320943.html
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