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FlowJo 里的组合门

已有 12883 次阅读 2010-1-6 05:47 |个人分类:FlowJo使用|系统分类:论文交流| FlowJo, 组合门, 细胞流式

在FlowJo里,你可以使用组合门的功能来界定你想要查看的细胞群,例如,CD3 AND NOT CD4 AND NOT CD8,  或者看“所有会产生细胞因子的T cell”, 
T cells AND IL-2 OR IFNg OR TNFa(只要是产生里面任意一个因子的T cell 都包括在内)
这个功能对测多个细胞因子的实验室有很大的帮助。

如何使用FlowJo 生成组合门功能?
具体步骤和结果如下:

1。设门, 可以设任意多的门,门数为n>=2

2。选中所设的门,到tool 菜单,选择Create Combination Gate

3。 你所有门的组合都会出现在样品下方。这些组合门数为2^n(2的n次方,如果不明白的话请回去重新学初中统计组合基本原理)。然后flowjo 还会自动的产生非门(NOT gate),所以总的产生门数为2^n+n

其它逻辑门工具的使用和在流式细胞分析里的意思?下面举例说明
AND: 与门。 CD4 AND CD8=CD4+CD8+, 既找个细胞群既要同时符合CD4和CD8
OR: 或门。 CD4 OR CD8= CD4+ 和CD8+, 两个条件符合其一就好。
NOT: 非门。 NOT CD4= 非CD4 细胞。

或者用更简单接近生活实际的比喻
你有2个找男/女朋友的要求
条件A= 有车,有房。 条件B=身高175cm以上
A and B: 你要求对方2个条件都符合
A OR B: 符合一个条件就好了
NOT A: 非有车,有房的(和它们有仇)
NOT B: 身高不是175cm 以上的,要矮于或等于175,你不喜欢高的。

同理, 你可以用此方法,做细胞内因子的分析。做各种的组合。



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