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枸杞具有高浓度的活性成分,在传统中草药中因其治疗特性而广为人知。然而,枸杞品种众多,活性成分含量各不相同,导致枸杞品种之间质量不一致。目前,很少有研究在分子水平上揭示不同品种枸杞有效成分含量的差异。本研究构建了“Ningqi No.1”和“Qixin No.1”在G、T和M三个发育阶段的材料,通过转录组分析共获得797570278个clean reads。在这两种类型的枸杞中,分别在“G1与G10”、“T1与T10”和“M1与M10”中获得了469、2394和1531个差异表达基因(DEG),并用GO和KEGG进行了注释。果实成熟期的代谢产物在M1和M10中分别有1135种不同表达的代谢产物,其中许多代谢产物与黄酮类、生物碱、萜类等活性成分有关。也通过理化指标检测总木质素,总黄酮,总类胡萝卜素含量差异。本研究结果为不同品种枸杞多种活性成分的生物合成和积累动态提供了分子见解,为枸杞果实品质的形成和优秀品种的选育提供了基础数据。
1题目
Integrative transcriptome and metabolome analysis reveals the discrepancy in the accumulation of active ingredients between Lycium barbarum cultivars.
2杂志
Planta; IF5years=4.8分
3链接
Liu, X., Gao, H., Radani, Y. et al. Integrative transcriptome and metabolome analysis reveals the discrepancy in the accumulation of active ingredients between Lycium barbarum cultivars.Planta (2024). https://doi.org/10.1007/s00425-024-04350-0.
4检测指标
Norminkoda提供总木质素,总黄酮,总类胡萝卜素试剂盒。
5主要内容
Fig 1:表型数据
Fig 2:转录组数据分析(相关性,差异DEG, UpSet Venn等)。
Fig 3:转录组数据GO和KEGG分析.
Fig 4:黄酮和木质素相关通路分析.
Fig 5:萜类(类胡萝卜素)相关通路分析。
Fig 6:理化指标分析(总木质素,总黄酮,总类胡萝卜素)。
Fig 7:关键基因qPCR表达分析。
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