目的：说明了Materials Studio与CSD的结合使用。

所用模块：Materials Visualizer、Polymorph、VAMP、Forcite、COMPASS

前提条件：绘制简单分子结构的可视化工具（Sketching simple molecules Visualizer）教程

介绍

剑桥结构数据库（CSD）是一个小分子晶体结构的存储库。它是剑桥晶体数据中心（CCDC；http://www.ccdc.cam.ac.uk）的主要产品。CSD记录有机分子和金属有机化合物的参考文献、化学和晶体学信息。

本教程说明使用CSD中的信息为Materials Studio计算的结果添加可用信息的方法。本教程预测小分子化合物的多晶型，并将其与CSD中收录的该化合物的已知晶体结构进行比较。

注意：

• 本教程需要CSD许可。

• 本教程中描述的结果是使用CCDC v.5.31, 2010版本获得的。如果CCDC版本不同，可能会观察到不同的数值结果。

本教程包括如下部分：

• 开始

• 绘制并优化结构

• 预测多晶型并识别已知的实验结构

注意：为了和本教程中的参数保持一致，可以使用Settings Organizer对话框将项目中所有参数都设置为BIOVIA的默认值。

1、开始

首先启动Materials Studio并创建一个新项目。

打开New Project对话框，输入CSD作为项目名，单击OK按钮。

新项目将以CSD为项目名显示于Project Explorer中。

2、绘制并优化结构

本教程使用Polymorph模块生成P 21/c空间群的3-oxabicyclo(3.2.0)hepta-1,4-diene（3-恶唑环(3.2.0)庚-1,4-二烯，OHD）可能的多晶型列表。生成此列表后，可以验证其中一个低能量填充排列确实对应于实验上已知的晶体结构。

在Project Explorer中，右键单击项目名CSD并选择New | 3D Atomistic Document。将新建的结构文件的名称更改为OHD-mol。使用绘图工具，绘制如下所示的OHD分子。

接下来，使用VAMP模块优化分子结构。

从菜单栏中选择Modules | VAMP | Calculation，打开VAMP Calculation对话框。在Setup选项卡上，将Task更改为Geometry Optimization。单击Run按钮，并关闭对话框。

计算结束后，保存项目，并关闭所有窗口。

从菜单栏选择File | Save Project，然后选择Window | Close All。

【系列教程】

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