GO与KEGG分别为两个主要进行基因功能，结构富集的数据库。在基因组或转录组测序中，我们经常能够在不同的个体或者群体中，发现一些差异基因。对差异基因进行分析，可能会挖掘到个体或者群体之间差异的原因。

通过GO富集能够将差异基因富集到生物过程，细胞分布，结构功能中。在进行富集时，每一个富集项均有一个GO id号，通过差异基因的富集能够获取唯一的GO id号，然后将基因富集到不同的通路上。能够富集到的通路，往往有很多，因此我们挑选p-value较高的通路进行解释。

KEGG主要关注信号通路，KEGG数据库能够将差异基因富集到不同的通路上，基本思想来说，GO与KEGG富集分析是一致的。