1. 安装CUDA

(1) $sudo yum install gcc gcc-c++

(2) $sudo yum install kernel-devel

(3) $sudo yum install kernel-devel-$(uname -r) kernel-header-$(uname -r)
(4) 禁用Nouveau。新建文件/etc/modprobe.d/blacklist-nouveau.conf，在其中写入以下两行：

     blacklist nouveau
     options nouveau modeset=0

     输入命令：$sudo dracut --force

(5) 切换到文本模式：$systemctl set-default multi-user.taget

    $sh ./cuda_xxx.run

(6) 切换到图形模式，重启

    $systemctl set-default graphical.taget

安装后系统无法重启，重新安装CentOS 7。查询机器中的GPU型号：

    $spci | grep -i nvidia

02:00.0 3D controller: NVIDIA Corporation GM108M [GeForce 940MX] (rev a2)

在cuda官网没有查询到对该GPU的支持信息，可能由于cuda对GPU不支持导致系统安装cuda后系统启动失败，故而放弃cuda安装。

2. 安装cmake

    $cd /home/sunyp/software/source

    $wget https://cmake.org/files/v3.11/cmake-3.11.1.tar.gz

    $tar cmake-3.11.1.tar.gz -C ../build

    $cd ../build/cmake-3.11.1

    $bootstrap

    $make

    $sudo make install

3. 安装gromacs

    $cd /home/software/source

    $wget ftp://ftp.gromacs.org/pub/gromacs/gromacs-2018.1.tar.gz

    $tar gromacs-2018.1.tar.gz -C ../build/gromacs-2018.1

    $mkdir build

    $cd build

    $cmake .. -DGMX_BUILD_OWN_FFTW=ON -DREGRESSIONTEST_DOWNLOAD=ON

    $make

    $make check

    $sudo make install

    $source /usr/local/gromacs/bin/GMXRC

    $sudo ln -s /usr/local/gromacs/bin/gmx /usr/local/bin/gmx