博文
- 置顶 · 升级版|16srRNA微生物多样性测序报告解读
- 微生物多样性测序（扩增子测序）是基于二代高通量测序对16S/18S/ITS等序列进行测序。可以同时检测样本中的优势物种、稀有物种及一些未知物种的检测，获得样本的微生物群落组成以及相对丰度。 相信关注我们的小伙伴对此并不陌生。 这次我们整合了大家平时会遇到的一些问题，在原有的基础上对报告进一步完善。 ...
- 置顶 · [转载]多快好省的宏基因组研究技巧 — 资深专家分享
- 谷禾健康 原创 近年的研究热点集中于环境和生物体相互作用的微生物群体，而大量复杂的微生物群体存在培养困难，构成复杂（包括细菌、古菌、真菌、原生生物、病毒甚至小型真核生物）。因此 如何用高通量精准的了解这些群体的构成，基因功能分布以及具体的表达活性和代谢状况 成为首要问题。 高通量测序技术 ...
- 置顶 · [转载]微生物多样性测序结果如何看？
- 原文 如何读懂和利用你的微生物多样性测序结果？ 谷禾健康 原创 做过16s测序的小伙伴们都知道 测完之后会拿到一份结果报告 但这并不代表可以开始写文章了 看似一大堆数据图表却不知如何下手 这是很多人头疼的地方 那么怎样给报告中的数据赋予灵魂 让它真正成为对你有帮助的分析呢？ 今天我们来详细解 ...
- [转载]吃什么、怎么吃、何时吃：饮食节律与营养饥饿塑造肠道微生物组及健康状态
- 在当代营养流行病学的视野中，我们长期致力于 寻找一种最佳饮食模式 。无论是地中海饮食、生酮饮食还是植物基饮食，焦点往往集中在 吃什么 。然而，这种静态的视角 忽略 了人类饮食行为中最显著的一个特征： 时间上的波动性 。 举个例子，工作日与周末的割裂，很多人在 周一至周五严格控制热量 ，吃高纤维的 ...
- [转载]肠道菌群氨基酸代谢：调控宿主营养与生理
- 氨基酸（AA）稳态 对 人体健康 至关重要，其 紊乱 与多种 疾病的发生和进展 密切相关，如 2型糖尿病 和 炎症性肠病 （IBD），并且常常是 治疗结果 的 决定性因素 。 肠道微生物群可能通过多种机制 调节宿主氨基酸的可用性 ，例如 影响消化酶 （如胰蛋白酶）的活性。肠道微生物群定殖还可能 改变肠道通透性 ...
- [转载]镁缺乏与人体疾病的关联，如何更好地改善低镁状态？
- 镁是人体中 调节多种生理和病理过程 的 必需营养素 。作为几百种酶促反应的 辅因子 ，它参与 能量合成、蛋白质与DNA稳定 、 神经传导 、 骨骼健康、肌肉收缩 以及 心律调节 等多种生理过程。镁不仅是 细胞能量代谢 的核心元素，还在维持 离子稳态、抗氧化防御 和 炎症调节 中扮演着关键角色，被誉为“ 细胞 ...
- [转载]常见儿科疾病的早期肠道菌群：作用和治疗意义
- 宝宝 湿疹反复瘙痒 总难根治，季节交替时喷嚏不断，擦不完的鼻涕， 整晚咳嗽 甚至发展为哮喘，到了学龄期孩子仍 无法专注听讲 ... 如今约 40% 中国儿童在成长过程中会出现至少一种过敏症状（尤其是过敏性鼻炎）， 神经发育 问题发生率也逐年上升 。 多中心流行病学调查和系统综述显示： 神经发育障碍整 ...
- [转载]犬猫肠道微生物组的功能性营养干预
- 宠物 营养 健康 在全球范围内，猫犬早已 不再 只是传统意义上的“宠物”，而成为许多家庭中 重要的“毛孩子” 。这种“ 宠物人性化 ”的趋势，极大地推动了宠物主人对爱猫爱犬健康的关注，促使他们寻求超越传统温饱的、 更精细化、科学化 的喂养方案。 如今， 延长宠物寿命 、 提升健康福祉 已成为宠物 ...
- [转载]annoSnake：一款用于宏基因组和MAGs的模块化、一站式自动化注释管道
- 如果你正为 宏基因组数据 的组装和注释而忙于“拼工具、调环境、转格式”，那么 annoSnake 或许能让你从繁琐中解放。 它是一个基于Snakemake的 自动化工作流程 ，从 clean reads组装 到 物种分类、功能注释 ，再到MAGs的装配和注释。 作为开源工具，annoSnake具备良好的 可重复性、可扩展性 和 可移植性 ...
- [转载]肠道中代谢潜力菌——厌氧棒状菌属（Anaerostipes），产丁酸，多种慢病中缺乏/下降
- 厌氧棒状菌属（ Anaerostipes ）隶属于厚壁菌门下的 毛螺菌科 ，是一类 革兰氏阳性 厌氧产丁酸菌 ，在维持 宿主肠道稳态 与 代谢平衡 中具有关键作用。 该菌属的显著特征是能够 产生丁酸 ，并且其中的 A.caccae 与 A.hadrus 还能利用体内的 乳酸与乙酸 ，将其转化为 丁酸 。一些菌株还拥有 维生素B₁ ...
- [转载]全面认识肌醇——连接代谢、神经、皮肤和肠道微生态的类糖分子
- 肌醇 （Inositol，i-Inositol或myo-Inositol） 肌醇，它不仅是构成 细胞膜的基础材料 ，更是一个连接 新陈代谢、细胞信号 和 肠道微生态 的核心枢纽。在其九种立体异构体中，主要以其特定形式（myo-inositol） 参与广泛的生理过程 ，包括构成细胞膜磷脂、介导胰岛素信号、调节渗透压、基因表达等。 近年 ...
- [转载]影响代谢及肥胖的重要细菌——丹毒丝菌科（Erysipelotrichaceae）
- 丹毒丝菌科 （Erysipelotrichaceae）是厚壁菌门（Firmicutes）中的一类重要细菌，广泛存在于 人体肠道 中，因其在 健康与疾病调控 中的重要作用而备受关注。 丹毒丝菌科参与 食物分解与能量代谢 ，并在 脂质代谢、胆汁酸循环和免疫调控 中发挥关键作用，对维持 机体代谢稳态 至关重要。 并且该家族的细菌 ...
- [转载]什么是胆碱，它与人体疾病有什么关系，如何平衡膳食胆碱
- 胆碱 （2-羟基‑N,N,N‑三甲基乙铵），是我们身体正常运转不可或缺的一种必需营养素。它的角色至关重要：一方面，它是构成 细胞膜 的重要原料，参与合成磷脂酰胆碱等物质来 维持细胞的完整结构 ；另一方面，它也是 神经递质“乙酰胆碱”的前体物质 ，在 大脑 与 神经 功能中扮演着关键角色。 正 ...
